Анализ кала на дисбактериоз посев

• Приём, исследование биоматериала
• Показания к назначению
• Описание

Приём и исследование биоматериала

Приём материала

• Можно сдать в отделении Гемотест
• Можно сдать анализ дома

Метод исследования

Микробиологический

Когда нужно сдавать анализ Микробиологическая диагностика дисбактериоза кишечника?

• Диарея.
• Атопический дерматит, хроническая диарея, поражения кишечника из-за действия ионизирующей радиации или химических веществ.
• Длительный период восстановления после кишечных инфекций.
• Длительно протекающие кишечные расстройства, при которых не удается выделить патогенные микроорганизмы.
• Дисфункция кишечника у пациентов, подвергавшихся длительному воздействию радиации, химических веществ и т. п., интенсивной антибиотико- и/или иммунодепрессивной, химио- и гормональной терапии.
• Наличие бактериемии, гнойно-воспалительных очагов, трудно поддающихся лечению (пиелиты, холециститы, язвенный колит, энтероколит, вялотекущие пневмонии).
• Проведенное хирургическое лечение при наличии факторов риска развития дисбактериоза кишечника.

Подробное описание исследования

Исследование кала на дисбактериоз проводится микробиологическим методом. Используется для оценки состояния микрофлоры кишечника, выявления причины диареи.

Исследование кала на дисбактериоз кишечника позволяет оценить состав микрофлоры и выявить в нем отклонения, а также разработать индивидуальный план терапии.

Дисбактериоз — это изменение качественного и количественного состава микробиоценоза кишечника. К этому состоянию могут приводить разные причины:

• изменение характера питания;
• воспалительные процессы;
• длительная антибиотикотерапия;
• хирургическое лечение;
• длительный стресс;
• иммунодефицит;
• проживание в нехарактерной климатической зоне (высокогорье, Арктика).

Нормальные бактерии ЖКТ:

• бифидобактерии;
• лактобактерии;
• типичные формы кишечной палочки;
• энтерококки;
• бактероиды (анаэробы).

Кроме «полезных» бактерий, в кишечнике существует условно-патогенная флора. Эти микроорганизмы в норме могут присутствовать в биотопе, но увеличение их количества влечет за собой изменение соотношения микроорганизмов в биоценозе прямой кишки и может приводить к клиническим проявлениям дисбактериоза. К таким микроорганизмам относятся:

• неферментирующие бактерии;
• грибки;
• энтеробактерии;
• клостридии;
• стафилококки.

В норме не обнаруживаются, но при заболеваниях встречаются патогенные бактерии. В их число входят:

• патогенные эшерихии;
• шигеллы;
• сальмонеллы.

Исследование позволяет определить характер изменений микрофлоры кишечника и выявить патологию, которая привела к ее развитию.

Что ещё назначают с этим исследованием?

Использованная литература

1. Методические рекомендации «Бактериологическая диагностика дисбактериоза кишечника», утв. Минздравом РСФСР — 1977.
2. Отраслевой стандарт «Протокол ведения больных дисбактериозом кишечника». ОСТ 91500.11.0004-2003.
3. Определение дисбиотических изменений желудочно-кишечного тракта по маркѐрам содержимого кишечника. Федеральные клинические рекомендации — 2005.
4. Клинические рекомендации национальной ассоциации специалистов по контролю инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи и общероссийской общественной некоммерческой организации «ассоциации колопроктологов России» по диагностике, лечению и профилактике Clostridium difficile-ассоциированной диареи (CDI) — 2017.
5. Chan BK, Abedon ST, Loc-Carrillo C. Phage cocktails and the future of phage therapy. Future Microbiol. 2013 Jun;8(6):769-83.
6. Robles Alonso V, Guarner F. Linking the gut microbiota to human health. Br J Nutr. 2013 Jan;109 Suppl 2:S21-6. Review.

• Подготовка к исследованию
• Противопоказания и ограничения

Подготовка к исследованию

• За 14 дней до анализа необходимо прекратить прием антибиотиков.
• За 72 часа до исследования — отказаться от использования ректальных свечей и масел, слабительных средств и клизм, приема препаратов, оказывающих влияние на работу кишечника и окраску кала.
• Биоматериал не должен содержать примеси мочи и воды. Нельзя собирать кал с памперсов, из горшков, медицинского судна, унитаза.

Противопоказания и ограничения

Абсолютных противопоказаний нет.
Факторы, влияющие на результат исследования:

• прием лекарственных средств с антимикробной активностью;
• прием препаратов, изменяющих перистальтику кишечника и цвет кала.

• Интерпретация результата
• Референсные значения

Интерпретация результата

Анализ на дисбактериоз кишечника показывает:

• повышение количества условно-патогенных бактерий на фоне нормального числа бифидобактерий;
• рост титра условно-патогенной флоры с падением концентрации бифидобактерий до 107–108 КОЕ/г;
• уменьшение числа лакто- и бифидобактерий без повышения концентрации условно-патогенных бактерий или сапрофитов;
• снижение количества бифидобактерий с одновременным массовым уменьшением числа лактобацилл, появлением кишечной палочки атипичной формы, обнаружением высоких титров условно-патогенной флоры (до 107–108 КОЕ/г).

Диагноз «дисбактериоз кишечника» основывается на результатах клинического обследования пациента и данных микробиологического исследования кала.

Следует учитывать динамическое изменение микробиоценоза толстого кишечника в зависимости от многих параметров состояния организма, в том числе и от состава пищи. Биоматериал одного пациента, полученный в разное время, не всегда будет идентичен по составу и количеству выделенных микроорганизмов.

Референсные значения

• Микрофлора Результат Bifidobacterium (бифидобактерии): 10*9–10*10
• Lactobacillus (лактобактерии): 10*7–10*8
• E.coli (кишечная палочка с нормальной ферментативной активностью): 10*7–10*8
• E.coli (кишечная палочка со сниженной ферментативной активностью): <10*5
• E.coli (лактозонегативная кишечная палочка): </=10*5
• E.coli (гемолизирующая кишечная палочка): 0
• Enterococcus (энтерококки): 10*5-10*8
• Микробы рода Proteus (протей): </=10*4
• Klebsiella (клебсиелла): </=10*4
• Enterobacteriaceae (энтеробактерии): Hafnia (гафния), Serratia (серрация), Citrobacter (цитробактер) и другие: </=10*4
• Еnterobacter (энтеробактер): </=10*4
• Staphylococcus aureus (стафилококк золотистый): 0
• Staphylococcus epidermidis (стафилококк эпидермальный): </=10*4
• Грибы рода Candida (кандида) и другие дрожжевые грибы: </=10*4
• Неферментирующие грамотрицательные бактерии: </=10*4

• Приём, исследование биоматериала
• Показания к назначению
• Описание

Приём и исследование биоматериала

Приём материала

• Можно сдать в отделении Гемотест
• Можно сдать анализ дома

Когда нужно сдавать анализ Посев кала на микрофлору?

Для установления возбудителя кишечной инфекции.
Для дифференциальной диагностики (наряду с другими исследованиями) заболеваний, протекающих со сходными симптомами (диарея, воспалительные заболевания кишечника, колоректальный рак, болезни, сопровождающиеся нарушением всасывания).
Для того чтобы оценить эффективность проводимой антибактериальной терапии.

Подробное описание исследования

Условно-патогенная флора – это микроорганизмы, которые присутствуют у человека в умеренных количествах.
Однако при определенных условиях их количество увеличивается и превышает допустимую норму, что приводит к соответствующим заболеваниям.
К наиболее распространенным представителям условно-патогенной флоры кишечника относятся:

• золотистый стафилококк (S. aureus)
• клебсиеллы (Klebsiella), эшерихии (Escherichia)
• энтеробактер (Enterobacter)
• цитробактер (Citrobacter)
• ацинетобактер (Acinetobacter)
• протей (Proteus)
• клостридии (Clostridia)
• серрации (Serratia)
• псевдомонады (Pseudomonas)
• дрожжеподобные грибы (Candida и др.) и другие возбудители.

Эти микроорганизмы могут вызывать инфекционное поражение желудочно-кишечного тракта с развитием гастроэнтерита, энтерита и энтероколита.

Что ещё назначают с этим исследованием?

Другие названия этого исследования

Названия на русском языке

Посев кала на УПФ

• Подготовка к исследованию
• Противопоказания и ограничения

Подготовка к исследованию

Исследование рекомендуется проводить до начала приема антибиотиков и других антибактериальных химиотерапевтических препаратов.
Исключить прием слабительных препаратов, введение ректальных свечей, масел, ограничить прием медикаментов, влияющих на перистальтику кишечника и на окраску кала, в течение 72 часов до сбора кала. Кал собирается естественным путем.
Кал должен быть получен без применения клизм и слабительных средств.
Биоматериал собирается при условии самостоятельного опорожнения кишечника,
Биоматериал собирают с чистой и не впитывающей влагу поверхности (чистый пакет, клеёнка).
Допускается использование судна или горшка. Ёмкость хорошо промывают с мылом, многократно ополаскивают водой, а затем обдают кипятком и остужают.
Доставляют в лабораторию в специальном контейнере в течение 3-х часов после сбора.
Для исследования достаточно 1-2 чайных ложки.

Противопоказания и ограничения

Факторы, влияющие на результаты исследований

Предшествующая антибактериальная терапия или химиотерапия ведет к ложноотрицательному результату.

• Интерпретация результата
• Дополнительное обследование при отклонении от нормы

Интерпретация результата

Если в посеве наблюдается умеренный рост условно-патогенных микроорганизмов (не превышающий норму), то утверждать, что они вызвали кишечную инфекцию, нельзя.
Обильный рост условно-патогенных микроорганизмов (превышающий норму) свидетельствует о том, что они явились причиной развития инфекции.

Дополнительное обследование при отклонении от нормы

21.2. Копрограмма
19.52.1. Менингококк, гемофильная палочка, стрептококк (Neisseria meningitidis, haemophilus influenzae, streptococcus pneumoniae, ПЦР) плазма, кач.
21.7. Простейшие
21.5. Яйца гельминтов
20.14. Хеликобактер пилори IgG (кол)
19.52.2. Менингококк, гемофильная палочка, стрептококк (Neisseria meningitidis, haemophilus influenzae, streptococcus pneumoniae, ПЦР) соскоб, кач.

Прилетели как-то на Землю инопланетяне. Посмотрели: ледники тают, озоновые дыры растут, панды не размножаются. Стали думать, отчего это все. Спустились в московский район Бирюлево. Взяли сотню человек, раздели, пощупали, допросили. Сделали вывод: озоновые дыры — из-за брюнетов (много их попалось), панды не размножаются из-за мужиков — их на летающей тарелке оказалось больше половины. Ну, а глобальное потепление — из-за рубля: у всех жителей Бирюлево в карманах оказалась эта валюта. Улетели инопланетяне к себе домой и по результатам исследования напечатали своими зелеными щупальцами десять кандидатских диссертаций.

Вот как-то так и проводится «анализ на дисбактериоз». Поговорим об этом диагнозе с гастроэнтерологом GMS Clinic Головенко Алексеем.

Что не так с этим исследованием? Его же так часто назначают врачи!

1. Давайте оговоримся: его назначают врачи только в странах бывшего СССР. За пределами этих государств простой посев стула для выявления дисбаланса микрофлоры не выполняется. Вы не найдете указаний на необходимость этого исследования ни в руководстве WGO по синдрому раздраженного кишечника, ни в рекомендациях ACG (Американской коллегии гастроэнтерологов) по острой диарее, ни в стандарте AAFP (Американской ассоциации семейных врачей) по наблюдению новорожденных с коликами. Ну и, естественно, никакого диагноза «дисбактериоз» нет ни в Международной классификации болезней, ни в хотя бы одном (!) нерусскоязычном учебнике.
2. В нашем желудочно-кишечном тракте обитает не менее 1000 (тысячи!) видов бактерий, а число всех выявленных видов составляет 2172. Выполняя «анализ кала на дисбактериоз» мы помещаем в питательную среду стул и дожидаемся роста (появления колоний) приблизительно 20 видов бактерий, которые мы выбрали только потому, что они в состоянии расти в этой питательной среде. Большая часть кишечных обитателей не культивируется, то есть увидеть своими глазами их колонии в чашке Петри мы не можем. Иными словами, делая выводы о состоянии микрофлоры по размножению 20 видов, мы игнорируем подавляющее большинство бактерий.
3. Норму количества бактерий в стуле, которые мы видим в бланке анализа на дисбактериоз, определяли неизвестно как. Есть целый отраслевой стандарт лечения пациентов с дисбактериозом. В нем нет ни единой фразы о том, почему нормальным мы должны считать содержанием каких-нибудь энтерококков от 10^5 до 10^8 в грамме стула. Ссылок на литературу в стандарте полно, но, что подозрительно, среди них нет ни одной зарубежной публикации. Ну а сами статьи и учебники не описывают, как именно сравнивали микрофлору здоровых и больных людей, то есть как именно был сделан вывод о нормальном содержании той или иной бактерии.
4. Бактерии, обнаруживаемые в стуле (который формируется в толстой кишке) — это совсем не те же бактерии, что обитают в ротовой полости или тонкой кишке. Кроме того, бактерии в стуле (то есть в просвете кишки) — это совсем не бактерии, обитающие в слизи, защищающей кишечную стенку. Вообще, через наш пищеварительный тракт «пролетает» безумное количество чужеродных бактерий, грибов и вирусов. К счастью, большая их часть не могут подобраться к кишечной стенке: обитающая там пристеночная микрофлора конкурирует с «пришельцами». Мы называем это явление колонизационной резистентностью, и именно ему мы обязаны тем, что первая же проглоченная со стаканом московской воды условно-патогенная бактерия не вызывает у нас понос.
5. Состав и соотношение кишечных бактерий у каждого человека свои. Изучив (не посевом кала, конечно, а сложнейшими генетическими методами) состав бактерий в стуле, можно, например, угадать принадлежит ли образец жителю Нью-Йорка или побережья Амазонки. Ну, или в каком регионе отдельной страны (например, Дании). проживает человек, отправивший на анализ свои фекалии. В общем, истинный состав кишечной микрофлоры — наши «отпечатки пальцев», и предполагать некую общую норму, а уж тем более судить о «нормальности» флоры всего по 20 видам из 1000 — смешно.
6. То, будут ли размножаться бактерии на питательной среде, зависит не только от того, какие бактерии в стуле живут, но и от того, как стул собрали (с унитаза, со стерильной бумаги), как хранили (в холодильнике, у батареи, у окна), как быстро доставили в лабораторию. Много ли людей, которым рекомендовали анализ на дисбактериоз читали вот эту инструкцию, согласно которой кал нужно собрать в стерильную посуду, поместить в холодильник и нести в лабораторию не в руках, а в термосе с кубиком льда? Впрочем, даже при совершении этих действий результат анализа на дисбактериоз интерпретировать нормальный врач не может. А значит, не должен и пытаться это сделать.

В питательной среде появились колонии бактерий. К счастью для нас, действительно опасная Сальмонелла растет в питательной среде. Большая часть кишечных бактерий, увы, нет.

Так что, нет такого понятия — «дисбактериоз»?

Конечно, есть. Например, псевдомембранозный колит — тяжелое воспаление толстой кишки после антибиотика — самый настоящий дисбактериоз: погибли конкуренты, и поэтому размножается Clostridium difficile. Только для того, чтобы это лечить, совершенно не нужно констатировать очевидное — состав бактерий в кишке изменился. Достаточно подтвердить инфекцию (выявить токсины C.difficile) и назначить лечение.

Кишечная микрофлора, вне сомнения, влияет на все процессы в нашем организме. Пересадив стул от мыши с ожирением мышке с нормальным весом, у последней мы вызываем ожирение. Состав кишечных бактерий принципиально разный у людей с тревожностью и депрессией. Ну, а добавление пробиотика Bacteroides fragilis мышам, у которых искусственно вызвали аутизм, улучшает их социальные навыки. Прочитайте популярную книгу «Смотри, что у тебя внутри» известного микробиолога Роба Найта: наши знания о микрофлоре колоссальны, но применять их на практике (то есть для лечения болезней) мы пока только начинаем.

Состав бактерий можно и нужно изучать. Этому посвящено амбициозное международное исследование Human Microbiome Project с бюджетом $115 млн. Естественно, никакие «посевы стула» при этом не используются. Для анализа микробных «джунглей» кишечника используются методы метагеномики. Они позволяют описать, сколько уникальных последовательностей ДНК присутствует у конкретного человека, какие группы бактерий преобладают, а какие отсутствуют. К слову, когда такие технологии (например, секвенирование 16S-рРНК появились, выяснилось, что 75% видов, обнаруживаемых при генетическом анализе того же кала, вообще не известны науке.

Стоп. То есть делать посев стула вообще нет смысла?

Я этого не говорил. Мы обязательно выполняем посев стула, если хотим выявить рост по-настоящему вредных бактерий. Например, у человека с кровавой диареей мы пытаемся найти Сальмонеллу или Шигеллу, Кампилобактерию или особую разновидность кишечной палочки. Здесь посев кала жизненно необходим, ведь так мы сможем назначить лечение антибиотиком — убить конкретного возбудителя.

Грамотный врач выполняет диагностический тест только тогда, когда его результат может изменить лечение. Если и при «дефиците» лактобактерий, и при «избытке» кишечной палочки будет назначено одно и то же лекарство или диета, анализ является пустой тратой денег.

Полноценное исследование собственной микрофлоры уже можно сделать на коммерческой основе в США и Европе. Стоит «удовольствие» около 100 евро, и в результате генетического анализа микрофлоры вы получите заключение (например, вот такое) о преобладающих в вашем пищеварительном тракте бактериях. Проблема в том, что и эти результаты невозможно применить на практике. Потому что:

пока у нас НЕТ способа, избирательно менять состав кишечных бактерий.

Предположим, мы однозначно установили, что у человека имеется дефицит какой-то конкретной микроорганизмы (например, лактобактерий). Мы можем:

• Дать пробиотик (то есть конкретную живую бактерию) и надеяться, что она останется жить в кишечнике.
• Дать пребиотик (то есть «корм» для бактерии) и надеяться, что это усилит рост именно нужной нам бактерии.
• Дать антибиотик (яд для бактерии) и надеяться, что погибнет именно чрезмерно размножившаяся бактерия.
• Пересадить человеку чужую микрофлору — сделать трансплантацию фекальной микробиоты (ввести разбавленный стул здорового человека больному человеку).

Очевидно, избирательным действием можно считать только назначение пробиотика. Максимальная доза лучшего коммерческого пробиотика — это 10 млрд. жизнеспособных бактерий в дозе препарата. В кишечнике обитает около 100 триллионов бактерий. То есть, на каждую бактерию «из аптеки» приходится 10 тысяч бактерий, уже «проживающих» в кишке. Маловероятно, что это ничтожное количество бактерий сможет преодолеть колонизационную резистентность и «заселить» кишку. Кроме того, механизм действия пробиотиков (когда они работают) может вообще быть связан с не с самими бактериями: у трансгенных мышей, предрасположенных в воспалению кишечника это самое воспаление удалось остановить, применяя не «живой» пробиотик, а вообще ДНК и некоторые белки, выделенные из «убитого» температурой препарата.

Ну, а главное: одно дело — теория и лабораторные исследования, другое дело — клинические испытания (то есть изучение эффекта препаратов у людей). Разберем три типовых для России ситуации, когда человеку предлагают сдать «анализ кала на дисбактериоз»:

Колики у новорожденного

Мама жалуется, что ребенок много плачет. К слову, любой ребенок в первые три месяца жизни кричит от 117 до 133 минут в сутки (мета-анализ). Наличие или отсутствие колик (беспричинный крик более 3 часов за день хотя бы 3 дня в неделю), в целом, не влияет на риск задержки развития ребенка. В одном исследовании, простая беседа с родителями о «безопасности» колик уменьшала продолжительность плача с 2,6 до 0,8 часов в день. Дети — эмпаты.

Чаще бывает не так. Выполняется анализ кала на дисбактериоз, там, естественно (норма-то взята с «потолка»), обнаруживаются «отклонения». Назначается пробиотик. И часто ведь помогает: еще бы, ведь частота колик неумолимо снижается с возрастом ребенка. При этом уверенности в том, что пробиотики вообще эффективны при коликах, у нас нет. Многочисленные мета-анализы, посвященные лечению и профилактике этого состояния, не смогли однозначно подтвердить эффективность пробиотиков. Возможно, какое-то полезное действие оказывает пробиотик Lactobacillus reuteri. Вот только для того, чтобы назначить этот препарат, анализ кала на «дисбактериоз» нам совершенно не нужен.

Атопический дерматит у ребенка

Все уверены, что проблемы с кожей — от «живота». Будь это так, наверное, атопический дерматит прекрасно лечился бы пробиотиками. Но этот подход не слишком эффективен. Последний мета-анализ свидетельствует: применение пробиотиков (главным образом, Lactobacillus rhamnosus GG) несколько уменьшает выраженность экземы, но эффект этот весьма символический, а дополнительная терапия пробиотиком не позволяет сократить частоту применения местных стероидов, которые (вместе с увлажнением кожи) остаются основой лечения атопического дерматита. И вновь: назначить этот пробиотик мы можем вне зависимости от «результатов» «анализа на дисбактериоз».

Вздутие и спазмы в животе у взрослого

Вздутие живота чаще всего является проявлением избыточного бактериального роста в тонкой кишке (СИБРа), при котором помогает не пробиотик, а антибиотик, например, рифаксимин. Это состояние диагностируется при помощи специального дыхательного теста. Нередко постоянное вздутие живота является следствием внешнесекреторной недостаточности поджелудочной железы: дефицит ферментов в стуле можно выявить при помощи теста на фекальную эластазу, назначив при снижении постоянную терапию ферментами. Но чаще всего ощущение «вздутия» связано с повышенной чувствительностью кишки (висцеральной гиперчувствительностью), которая развивается у людей с синдромом раздраженного кишечника. Как вы уже догадались, для того, чтобы оценить количество бактерий в тонкой кишке, функцию поджелудочной железы или чувствительность кишки к растяжению, изучать 20 бактерий в кале бессмысленно. Да и эффективность пробиотиков при синдроме раздраженного кишечника вызывает сомнения.

Так нужно хоть в какой-то ситуации сдавать «кал на дисбактериоз»?

Нет. Никогда. Ни при каких обстоятельствах. Мы не лечим вздутие живота, изучая линии на ладони. Мы не лечим сыпь, глядя в хрустальный шар. Мы не делаем бессмысленный анализ на дисбактериоз, чтобы назначить лечение.

Мы ждем, когда доказательная медицина предложит нам эффективные препараты и практические способы понять, что не так с нашими бактериями.

Жду вместе с вами!

Источник: deti.mail.ru