Как проводится анализ на кишечные инфекции

Кишечные инфекции — это целая группа заболеваний, которые вызываются патогенными и условно-патогенными микроорганизмами. Такой тип патологий распространен достаточно широко. Встречаются как острые, так и хронические формы патологий.

Лечение пациента направлено на борьбу с бактерией или вирусом, ставшими причиной кишечной инфекции, но для этого необходимо точно знать, какой микроорганизм вызвал болезнь. Определить возбудителя помогает анализ кала на кишечную инфекцию.

Что показывает анализ

Данный тип обследование помогает определить тип патогенного микроорганизма, для этого бактерию помещают в питательную среду и следят за ее развитием, определяют степень ее вирулентности.

К группе кишечных инфекций относят как простые в лечении, так и достаточно серьезные заболевания, которые тяжело переносятся организмом и обладают высокой степенью заразности:

• Холера.
• Ботулизм.
• Сальмонеллез и брюшной тиф.
• Дизентерия.
• Коли-инфекция.
• Иерсиниоз.

И более простые формы, вызванные:

• Ротовирусом.
• Аденовирусом.
• Норовирусом.

Чаще всего причиной развития болезни становятся вирусы и немного реже бактерии. Иногда источником инфекции становится смешанная флора. Быстрый рост и развитие патогенных бактерий и вирусов возникает на фоне ослабления иммунитета, сопровождается тяжелой интоксикацией, и может стать причиной летального исхода.

Анализ кала в этом случае помогает выявить все группы микроорганизмов, находящихся в кишечнике и полезных, и условно-патогенных, и болезнетворный.

Показания к анализу

Поводом для проведения исследования образца кала становятся следующие симптомы:

• Температура тела, которая поднимается до 37- 39°С;
• Диарея, тошнота и рвота;
• Появление в кале примесей в виде крови и слизи;
• Слабость;
• Потеря аппетита;
• Сильные головные боли;
• Бледность кожных покровов.

Этот тип диагностики обязателен при поступлении ребенка в школу и детский сад. Он обязателен для работников, занятых в сфере питания и контактирующих с большим количеством людей.

Анализ проводится всем, находившимся в контакте с заболевшими, при контроле эффективности полученного лечения и после перенесенного заболевания.

Подготовка к процедуре

При подготовке к забору материала следует соблюдать ряд правил которые призваны обеспечить точность полученных данных:

• Следует за несколько дней до анализа прекратить прием лекарственных препаратов, особенно влияющих на микрофлору кишечника.
• При подготовке к анализу пересматривают рацион питания, исключая из него жирные блюда и жареные, содержащие большое количество приправ. Необходимо отказаться от продуктов, способствующих повышенному газообразованию.
• В период подготовки нельзя употреблять спиртные напитки, энергетики и газированную воду
• Нельзя вводить ректальные свечи и применять клизмы для лечения.
• В это время не проводят рентгенологические обследования с применением контрастных веществ.
• Доставка материала осуществляется в стерильном, плотно закрытом контейнере.
• При заборе материала не должно быть контакта кала с поверхностями, на которых могут находится вирусы и бактерии.
• В кал не должна попасть моча и вода
• Перед получение кала необходимо провести гигиенические процедуры и полностью освободить мочевой пузырь.

Исследование не рекомендуется проводить во время менструации.

Причины ложных результатов

Повлиять на результат анализа могут разные факторы, в том числе и не зависящие от пациента. Результат анализа изменяется, если нарушить порядок забора каловых масс, и по этой причине в материал попадут извне посторонние бактерии и вирусы.

На итоговый результат влияет прием антибиотиков и сорбентов, к которым относят такие препараты как, Энтеросгель, Полисорб, Активированный уголь.

Как проводится анализ

Забор материала должен осуществляться стерильной ложкой, она входит в комплект с емкостью, предназначенной для доставки кала в лабораторию. В пробу должны попасть участки со слизью, кровью и посторонними включениями.

Порядок исследования кала на бактерии и вирусы полностью зависит от предполагаемого диагноза. Для определения типа возбудителя колонии позволяют разрастись до большого размера на специально для этого предназначенной питательной среде.

Далее изучается активность микроорганизмов, их способность к быстрому размножению. Далее на колонию воздействуют различными видами антибиотиков для определения их чувствительности. Чаще всего микроорганизмы оказываются устойчивыми к воздействию большинства препаратов, поэтому выбор врачей ограничен одним или двумя наименованиями.

Длительность проведения исследования полностью зависит от активности изучаемой колонии, чем быстрее размножаются бактерии, тем быстрее удается получить необходимый результат. В среднем на проведение анализа уходит от трех дней до двух недель.

Нормы и расшифровка результата

Для оценки полученного результата используются специальные таблицы, в которых приведена норма содержания микроорганизмов различных типов в единице исследуемого вещества. К примеру, нормы содержания условно-патогенных микроорганизмов в кале здорового человека таковы:

• Стафилококки ≤104.
• Грибки рода Кандида ≤104.
• Пептококки 109–1010.
• Фузобактерии 108–109.
• Бациллы 109–1010.
• Клостридии ≤104.

Превышение этих норм является признаком патологии, например, развивающегося дисбактериоза.

При исследовании может быть выявлено присутствие патогенных микроорганизмов, которые вызывают следующие заболевания:

• Шигелла вызывает бактериальную дизентерию, отличается высокой степенью вирулентности и быстро вызывает сильнейшую интоксикацию организма.
• Сальмонелла приводит к сальмонеллезу, устойчива ко многим типам воздействия. Один из видов данного микроорганизма является возбудителем брюшного тифа.
• Холерный вибрион является возбудителем холеры, к которой присоединяются различные виды гнойных воспалений.
• Синегнойная палочка. Вызывает инфекционный энтероколит и другие типы инфекционных воспалений, отличается высокой степенью токсичности и устойчивостью к воздействию антибиотиков.

Наличие патогенных микроорганизмов – признак инфицирования, такая ситуация требует обращения к врачу, даже если пациента пока ничего не беспокоит.

Анализ кала на кишечную инфекцию в Москве – цены

[09-134]
Острые кишечные инфекции, скрининг (Shigella spp., E. coli (EIEC), Salmonella spp., Campylobacter spp., Adenovirus F, Rotavirus A, Norovirus 2 генотип, Astrovirus)

1920 руб.

Комплексное молекулярно-генетическое исследование, которое позволяет выявить генетический материал наиболее вероятных возбудителей острых кишечных инфекций в кале и установить этиологию заболевания.

Синонимы русские

ОКИ, ПЦР (кал).

Синонимы английские

Acute intestinal infection screening; Bacterial and viral diarrhea screening, PCR, fecal samples.

Метод исследования

Полимеразная цепная реакция в режиме реального времени.

Какой биоматериал можно использовать для исследования?

Кал.

Как правильно подготовиться к исследованию?

• Исследование рекомендуется проводить до начала приема антибиотиков и других антибактериальных химиотерапевтических препаратов.
• Исключить прием слабительных препаратов, введение ректальных свечей, масел, ограничить прием медикаментов, влияющих на перистальтику кишечника (белладонна, пилокарпин и др.) и на окраску кала (железо, висмут, сернокислый барий), в течение 72 часов до сбора кала.

Общая информация об исследовании

Острые кишечные инфекции (ОКИ) – группа заболеваний, обусловленных вирусами, бактериями или паразитами, для которых характерен фекально-оральный механизм передачи. Общими для данных инфекций являются факторы передачи: пищевые продукты, вода, инфицированные бытовые предметы и грязные руки. Первые симптомы возникают через несколько часов или дней после инфицирования, начало резкое, с появлением частого жидкого стула, рвоты, боли в животе, признаков интоксикации (лихорадки, озноба, тошноты). Заболевание может носить групповой характер и проявиться у нескольких человек, употреблявших инфицированную пищу или воду.

Согласно официальной статистике, в России до 65-67% заболеваний этой группы составляют ОКИ неуточненной этиологии. Если возбудитель инфекции неизвестен, эффективность противоэпидемических мероприятий ограничивается. Соотношение частоты выявления вирусных и бактериальных патогенов варьируется в разных возрастах: у детей до 3 лет на долю вирусных агентов приходится 80-90% заболеваний, на долю бактериальных – 10-20%; среди взрослых пациентов доля вирусных возбудителей снижается до 30%.

Shigella species и Esherichia coli – грамотрицательные палочковидные микроорганизмы из семейства энтеробактерий. К роду Shigella относятся патогенные бактерии S. dysenteriae, S. flexneri, S. boydii и S. sonnei, которые являются возбудителями шигеллеза (бактериальной дизентерии). Энтероинвазивные E. coli (EIEC) очень близки с шигеллами, синтезируют и выделяют шигеллоподобный токсин, способны проникать в клетки слизистой кишечника и разрушать энтероциты, что приводит к образованию язвенных дефектов в слизистой кишечника. За значительную часть случаев “бактериологически неподтвержденной дизентерии”, особенно у детей, ответственен энтероинвазивный эшерихиоз.

Бактерии рода Salmonella относятся к семейству энтеробактерий. S. typhi и S. parathyphi являются возбудителями брюшного тифа и паратифа. Существует множество серовариантов Salmonella species, способных вызвать у человека инфекцию по типу гастроэнтероколита, а также стать причиной внутрибольничных инфекций. Сальмонеллез может протекать в форме острой кишечной инфекции, тяжелой генерализированной инфекции или бессимптомного носительства. Окончательный диагноз ставится только после выделения возбудителя или обнаружения его ДНК.

Кампилобактерии являются одними из наиболее сложных для культивирования (которое требуется в ходе анализа) микроорганизмов. Это объясняется их микроаэрофильностью и возможностью подавления их роста сопутствующей флорой. Род кампилобактерий объединяет как возбудителей ОКИ (термофильные виды), так и сапрофитные и условно-патогенные виды, о чем необходимо помнить при выявлении этих микроорганизмов в клиническом материале. Применение наборов на основе ПЦР для определения термофильной группы кампилобактерий позволяет не только избежать трудоемкой и высокозатратной бактериологической работы, но и четко ограничить детекцию тех видов кампилобактерий, которые имеют этиологическую связь с острой кишечной инфекцией (С. jejuni, C. coli, C. lari, C. upsaliensis).

В соответствии с данными зарубежной литературы, норовирус – наиболее частый возбудитель вспышек ОКИ небактериальной этиологии. Эта особенность связана с низкой инфицирующей дозой и высокой устойчивостью в окружающей среде. ПЦР является “золотым стандартом” в клинической диагностике норовирусных инфекций.

Несмотря на несколько меньшую в сравнении с рота- и норовирусами распространенность, астровирусы составляют значительный пласт кишечных инфекций, у трети пациентов протекающий с явлениями колита. Ротавирусы группы А являются наиболее частой причиной спорадических заболеваний ОКИ у детей, а ДНКсодержащий аденовирус F (серотипы 40 и 41) нередко вызывает вспышки гастроэнтеритов у детей младшего возраста.

Для выявления и дифференциальной диагностики кишечных инфекций используются культуральные и молекулярно-генетические методы исследования генетического материала возбудителя в кале и определение концентрации специфических иммуноглобулинов в крови. ПЦР обладает преимуществом перед культуральными методами благодаря быстрому получению результатов, высокой специфичности и чувствительности исследования. Данный анализ позволяет со 100-процентной точностью определить возбудителя кишечного заболевания, а быстрая диагностика острых кишечных инфекций помогает избежать лишних процедур и оперативных вмешательств, своевременно начать лечение и ограничить очаг распространения инфекции.

Для чего используется исследование?

• Для установления этиологического фактора острой кишечной инфекции;
• для дифференциальной диагностики причин острого гастроэнтероколита (воспаления ЖКТ).

Когда назначается исследование?

• При симптомах острого гастроэнтерита, вероятно, инфекционной этиологии (жидкий частый стул, рвота, лихорадка, боли в животе);
• при одновременном или последовательном развитии ОКИ у нескольких членов семьи, у детей в детском учреждении или пациентов в стационаре;
• при подозрении на развитие внутрибольничной кишечной инфекции (при обострении симптомов энтероколита у пациента, находящегося на лечении по поводу ОКИ).

Что означают результаты?

Референсные значения: отрицательно.

Причины положительного результата:

• присутствие ДНК или РНК возбудителя ОКИ; этиология в зависимости от выявленного вида возбудителя (Shigella spp., E. coli (EIEC), Salmonella spp., Campylobacter spp., Adenovirus F, Rotavirus A, Norovirus (2-й генотип), Astrovirus).

Причины отрицательного результата:

• отсутствие инфицирования Shigella spp., E. coli (EIEC), Salmonella spp., Campylobacter spp., Adenovirus F, Rotavirus A, Norovirus (2-й генотип), Astrovirus.



Важные замечания

• Рекомендуется проводить исследование в первые 3 суток с начала заболевания, у госпитализированных пациентов – в первый день госпитализации.
• Важно помнить, что острый энтероколит может быть обусловлен и другими инфекциями (например, амебами, лямблиями, иерсиниями, клостридиями, протеями и др.) или неинфекционными причинами (токсинами, ядовитыми веществами, острой непроходимостью кишечника, тромбозом сосудов брыжейки, воспалительными заболеваниями кишечника, острым панкреатитом, аппендицитом, целиакией, острым гепатитом, мальабсорбцией, дивертикулитом).

Также рекомендуется

• Yersinia pseudotuberculosis, ДНК [ПЦР]
• anti-Shigella flexneri 1-5, anti-Shigella flexneri 6, anti-Shigella sonnei
• Посев кала на патогенную флору (диз. группа и тифо-паратифозная группа)
• Посев кала на условно-патогенную флору с определением чувствительности к антибиотикам
• Анализ кала на цисты простейших
• Копрограмма
• Общий анализ крови (без лейкоцитарной формулы и СОЭ)
• Лейкоцитарная формула
• Скорость оседания эритроцитов (СОЭ)

Кто назначает исследование?

Инфекционист, гастроэнтеролог, терапевт, педиатр.

Литература

• Борисов Л. Б. Медицинская микробиология, вирусология, иммунология. М.: МИА, 2005. – 736 с.
• Gómez-Duarte O., Bai J., Newel E. Detection of E. coli, Salmonella spp., Shigella spp., Yersinia enterocolitica, Vibrio cholerae, and Campylobacter spp. enteropathogens by Three-reaction Multiplex PCR. Diagn Microbiol Infect Dis. 2009 January; 63(1): 1-9. PMCID: PMC2701628.