Кишечная палочка какие сдавать анализы
В нашем организме живут миллионы бактерий — их общий вес составляет около двух килограммов. Кишечная палочка занимает среди них далеко не последнее место. Эта бактерия может долгое время помогать человеку в формировании микрофлоры и пищеварении, а может в один момент превратиться в серьезную медицинскую проблему. В нашей статье мы расскажем о способах выявления кишечной палочки.
Кишечная палочка: две стороны одной медали
Кишечная палочка, или Escherichia coli (Эшерихия коли) — это палочковидная бактерия, которая обитает в кишечнике человека и некоторых животных. Существует более сотни разновидностей этой палочки. Большинство из них совершенно безвредны, но некоторые могут вызвать серьезные заболевания.
Кстати
Один из редких видов кишечной палочки — штамм О141:Н4 — стал знаменит из-за эпидемии в Европе в 2011 году. Тогда в странах Европы и северной Америки за период с мая по июнь заболело примерно 4 000 человек, из них 43 человека погибло.
У здорового человека Escherichia coli живет в толстом кишечнике. Ее количество обычно составляет 104–1010 КОЕ в 1 мл содержимого. В кишечнике эта бактерия участвует в переваривании пищи, синтезирует нужные нам витамины, а также производит органические кислоты. Эти кислоты создают благоприятную среду для развития лакто- и бифидобактерий.
У организма человека есть различные механизмы, которые помогают контролировать количество бактерий и ограничивать места их «обитания». Но если механизм дает сбой, могут возникнуть как легкие проходящие расстройства, так и действительно серьезные заболевания, иногда с летальным исходом. Из-за кишечной палочки могут развиваться различные заболевания: от диареи до тяжелого менингита и коли-сепсиса. Обнаружение бактерии в любых органах, кроме толстого кишечника, уже говорит о развитии нарушений.
Чаще всего кишечная палочка попадает в другие органы при нарушении гигиены или при снижении иммунитета. Попадая в женскую половую систему, она вызывает кольпит, аднексит, другие воспалительные заболевания. Особенно опасно заражение при беременности и после родов. Это может вызвать внутриутробную инфекцию у ребенка и стать причиной послеродового эндометрита у матери. Мужчин эта опасность тоже не обходит стороной. Кишечная палочка, попавшая в уретру, может вызвать уретрит, простатит, воспаление придатков и яичек.
Кроме этого, нормальная кишечная палочка может мутировать и становиться действительно опасной. Некоторые виды этой бактерии, например O157:H7, O104:H4, O121 и O104:H21, выделяют сильные токсины. Они могут вызвать гемолитико-уремический синдром, перитонит, пневмонию, пищевые отравления.
Чаще всего мутировавшая кишечная палочка попадает в организм вместе с продуктами питания, такими как немытые овощи, плохо обработанное мясо, молоко. Но в некоторых случаях такие штаммы могут образоваться внутри организма в результате мутаций и обмена генами.
Когда может быть назначен анализ
Патогенная кишечная палочка нередко вызывает диарею. Обычно эшерихиозом страдают дети младшего возраста и люди, путешествующие в страны с низким уровнем гигиены (так называемая диарея путешественников). Вовремя проведенный анализ позволит выявить кишечную палочку и начать лечение.
Некоторые опасные штаммы кишечной палочки могут вызвать гемолитико-уремический синдром (ГУС). Это тяжелое состояние, при котором в мелких сосудах образуется большое количество тромбов, собственные эритроциты разрушаются и возникает полиорганная недостаточность — тяжелая стресс-реакция организма. При любом подозрении на ГУС обязательно проводят анализ на энтеропатогенные (опасные) эшерихии.
Обычный бактериологический анализ, который проводят при воспалительных заболеваниях органов половой системы, послеродовых эндометритах и других, — также может показать наличие кишечной палочки.
Еще одним показанием к проведению исследования является дисбактериоз. Изменение состава микрофлоры кишечника может привести к проблемам с пищеварением, к урчанию и болям в животе. Нарушение образования витаминов и повышенное всасывание токсинов приводит к слабости, утомляемости и другим неспецифическим симптомам.
Какие типы анализов назначают при подозрении на патологический процесс
Кишечную палочку можно обнаружить в кале, в моче, в мазках с поверхности половых органов или из ран, при посеве промывных вод. Также во время исследований она может быть обнаружена в ране, в легких.
Основным методом анализа для обнаружения кишечной палочки является бактериологический посев. Для этого небольшое количество материала помещают в питательную среду, на которой бактерии очень хорошо размножаются. Результат подсчитывают через несколько дней по количеству образовавшихся колоний. Единица измерения — КОЕ/мл, то есть количество бактерий, из которых при исследовании выросли колонии, в миллилитре материала.
На выращенных колониях проводят тест с чувствительностью к антибиотикам или бактериофагам. Для этого в чашку Петри помещают микробы и выкладывают на ее поверхность диски, содержащие определенный антибиотик. Если антибиотик действует, рядом с диском образуется «пустое» кольцо, в котором роста микроорганизмов нет. Так же поступают и с бактериофагами.
Кроме ручного способа существует и полуавтоматический метод исследования чувствительности. Для этого микроб «засевают» не на чашки Петри, а на специальные кассеты, уже содержащие определенный набор антибиотиков. После эти кассеты помещают в анализатор.
Также существует метод ПЦР-диагностики. Он позволяет сказать, присутствует ли в материале патогенная кишечная палочка. Но ни количество бактерий, ни их чувствительность к лекарственным препаратам этот метод не покажет.
Другие методы, которые не подразумевают выделение чистой культуры кишечной палочки, могут сказать о заражении только косвенно. Например, в общем анализе мочи могут обнаружить бактерии в виде палочек. Но для того чтобы определить их вид придется сдавать дополнительно бактериологический посев. Похожая ситуация и с копрограммой. Анализ может дать представление о состоянии желудка и кишечника, но не позволяет выявить конкретные бактерии.
Общий анализ крови позволяет выявить характерные для воспалительных заболеваний сдвиги. Но они могут быть вызваны не только эшерихиозом, но и дизентерией, пневмонией или любым другим воспалительным заболеванием.
Как сдавать биоматериал для анализа на кишечную палочку
Любое бактериологическое исследование нужно проводить до начала лечения антибиотиками. В противном случае можно получить ложноотрицательный результат.
Анализ кала на кишечную палочку собирается в стерильную пробирку с транспортной средой. Для этого нужно заранее подготовить судно или другую емкость, тщательно вымыть ее и ополоснуть кипятком. В эту емкость собирается кал после естественной дефекации. Из специальной пробирки с транспортной средой нужно достать аппликатор, погрузить его в несколько участков собранного биоматериала и снова убрать в пробирку, плотно закрыв крышку. Если в собранном материале присутствуют кишечные палочки, бактериологический анализ это покажет.
Знаете ли вы, что…
кишечная палочка попадает в организм ребенка в первые же дни его жизни. Уже через 40 часов после рождения кишечник малыша заселен нормальной микрофлорой, в том числе и кишечной палочкой. Такое «сожительство» будет продолжаться всю его жизнь.
Анализ мочи на бактериологическое исследование тоже собирают в специальную стерильную емкость. Собрать материал можно в любое время суток. Перед этим обязательно нужно принять душ, чтобы в емкость не попали бактерии с поверхности кожи. Чем скорее получится доставить материал в лабораторию, тем лучше.
Мазки и соскобы урогенитального тракта при подозрении на уретрит, вагинит и любые другие мочеполовые заболевания, вызванные кишечной палочкой, забирают сразу в лаборатории или на приеме врача. Специальной щеточкой делается соскоб из уретры, со стенок влагалища или с шейки матки. Это не очень приятная процедура, но без нее не обойтись.
В каком виде и когда выдаются результаты
Быстрый анализ, который позволяет выявить в материале ДНК кишечной палочки, проводится за 1–2 рабочих дня. Результат бактериологического анализа на кишечную палочку придется ждать дольше — от 5 до 7 дней. За это время выращивается культура клеток, определяется их вид, проводится анализ на чувствительность к антибиотикам и бактериофагам.
В норме кишечной палочки не должно быть нигде, кроме толстого кишечника. То есть если вы сдаете мочу или мазок, то лучший результат — это отрицательное заключение. Если речь идет о содержимом кишечника, то здесь не должно обнаруживаться энтеропатогенных кишечных палочек, таких как O157:H7. В некоторых лабораториях проводят быстрый ПЦР-тест на целую группу таких бактерий.
При определении чувствительности к антибиотикам или бактериофагам выдается бланк, на котором напротив каждого наименования написана степень влияния препарата на рост бактерии. По такому бланку врач за несколько минут подберет наиболее эффективный для конкретного случая антибиотик.
Где можно сдать анализ на кишечную палочку
Анализ на эшерихиоз можно сдать как в обычной поликлинике, так и в частной лаборатории. Желательно заранее уточнить, какой метод исследования при этом используется.
Бактериологические исследования лучше проводить в клиниках и лабораториях, оснащенных автоматическими и полуавтоматическими анализаторами. Это исключает человеческий фактор, позволяет проводить исследование с широким перечнем антибиотиков и бактериофагов. Такие оснащенные лаборатории имеют как современные государственные больницы, занимающиеся лечением инфекционных болезней, так и частные медицинские центры.
Также стоит обратить внимание на время проведения исследования. Для бактериологического исследования это не менее пяти дней. Раньше бактерия просто не успеет вырасти в достаточном для анализа количестве. Время больше 7–10 дней говорит о том, что исследование будет проводиться в сторонней лаборатории. Это существенный недостаток, поскольку речь идет о транспортировке биоматериала, что нежелательно: чем раньше был доставлен материал, тем более достоверным будет результат.
Так как с результатами исследования еще придется идти к врачу для назначения лечения, не стоит выбирать неизвестные лаборатории по принципу «ближе к телу». Врач может просто не поверить полученным результатам и отправить сдавать анализ заново в свою больницу или в лабораторный центр, которому он доверяет. А это повлечет дополнительные временные и денежные траты.
Кишечная палочка — неотъемлемая часть микрофлоры кишечника. Пока она находится под контролем организма, ее клетки помогают синтезировать витамины, переваривать пищу, создавать благоприятную среду для жизни других полезных микробов. Но любое нарушение этого равновесия грозит патологиями вплоть до серьезных воспалительных заболеваний. К счастью, медицина помогает нам вовремя выявить отклонения от нормы и приять соответствующие меры.
Источник
Диарогенные E. coli включены в перечень возбудителей, поиск которых в соответствии с Российскими нормативно-методическими документами обязателен для этиологической расшифровки каждого случая ОКИ. Диарогенные E. coli, ассоциируемые с ОКИ, включают шесть патогенетических групп: энтеропатогенные E. coli (EPEC), энтеротоксигенные E. coli (ETEC), энтерогеморрагические E. coli (EHEC), энтероинвазивные E. coli (EIEC), энтероаггрегативные E. coli (EAgEC) и диффузноадгерентные E. coli (DAEC). EAgEC и DAEC – наименее изученные группы диарогенных эшерихий. Не все представители групп EAgEC способны вызывать ОКИ у человека, как правило, болеют лица с ослабленной сопротивляемостью к инфекциям (дети раннего возраста, лица пожилого возраста, ВИЧ-инфицированные и др.). Перечисленные выше группы эшерихий различаются по ключевым механизмам патогенеза и наличию специфических факторов вирулентности. Эволюционная близость эшерихий разных групп делает возможным постоянный обмен генетической информацией и естественное появление штаммов, обладающих уникальными наборами факторов вирулентности.
Показания к обследованию
- На эшерихии группы EHEC – ОКИ с симптоматикой гемоколита, а также развитие анемии, тромбоцитопении, гемолитико-уремического синдрома (HUS) у детей на фоне или после перенесенного диарейного заболевания (гемоколита);
- на эшерихии группы EIEC – классический гемоколит с тенезмами и ложными позывами на дефекацию, клинически сходный с бактериальной дизентерией;
- на эшерихии группы ЕТЕС – энтерит с водянистыми испражнениями и отсутствием лихорадки выше 38°С;
- на эшерихии группы ЕРЕС – ОКИ у детей раннего возраста (до 6 месяцев), особенно в очагах групповой, в т. ч. внутрибольничной инфекции.
Материал для исследований. Образцы фекалий.
Этиологическая лабораторная диагностика включает выделение чистых культур микроорганизма и проведение их видовой и серотиповой идентификации; выявление ДНК возбудителя.
Сравнительная характеристика методов лабораторной диагностики. Выделение чистых культур микроорганизма из биологического материала (испражнений), проведение их видовой и серотиповой идентификации – классический метод выявления диарогенных эшерихий. Родовая и видовая идентификация проводится с использованием краткой и расширенной схем биохимических характеристик. Серотиповая и серогрупповая принадлежность с определением О-, Н- и К-антигенов проводится с использованием поливалентных и моновалентных сывороток и иммуноглобулинов. Критерием отнесения изолята E. coli к той или иной патогенетической группе является его принадлежность к определенному серотипу. Альтернативным методом диагностики заболеваний, вызванных диарогенными E. coli, является детекция генов, кодирующих факторы вирулентности, обуславливающие принадлежность штамма к одной из шести групп, методом ПЦР. Наибольшее распространение имеют наборы реагентов на основе ПЦР для выявления возбудителей группы ЕНЕС.
Существуют наборы реагентов, объединяющие культуральный этап обогащения биологического образца с последующей детекцией АГ ЕНЕС методами ИФА или ИХА.
Применение культуральных методов выявления диарогенных эшерихий имеет ряд существенных ограничений:
- наличие в образцах фекалий E. coli – представителей нормальной флоры кишечника;
- высокая себестоимость и низкая эффективность проведения серотипирования патогена;
- отсутствие четкой корреляции между принадлежностью изолята к одной из шести групп диарогенных E. coli с его О-антигенными свойствами.
Диагностические исследования с использованием ПЦР, лишенные перечисленных недостатков, находят все более широкое применение для выявления диарогенных эшерихий в клинической практике.
При решении эпидемиологических задач наиболее информативным является комплексный подход с параллельным применением культуральных методов и ПЦРисследований (селекция образцов клинического материала, содержащих диарогенные E. coli при использовании наборов реагентов для детекции ДНК патогена методом ПЦР, культуральное выделение изолятов E. coli из данных образцов, подтверждение их принадлежности к определенной патогенетической группе с повторным применением ПЦР-исследований, антигенная характеристика конкретного диарогенного изолята).
Для выявления эшерихий группы ЕНЕС разработаны наборы реагентов с использованием ИФА или ИХА для детекции 0-антигенов и шигаподобных токсинов с обязательным культуральным обогащением биологического материала (в отличие от наборов с использованием ПЦР).
Показания к применению различных лабораторных исследований. Культуральный метод является основным, он позволяет проводить одновременно комплексное исследование для выявления патогенных энтеробактерий (шигеллы, сальмонеллы, эшерихии). На фоне приема антибактериальных препаратов, на поздних стадиях заболеваний, на фоне возникновения специфических осложнений в виде гемолитико-уремического синдрома, анемии и тромбоцитопении, при возникновении групповых случаев заболеваний, целесообразно применять выявление НК диарогенных эшерихий методом ПЦР, поскольку исследование выявляет не только живые, но и погибшие микроорганизмы, а также фрагменты их генома. При целенаправленном поиске эшерихий группы EHEC, из-за высокого риска развития осложнений, угрожающих жизни, возникновения массовых заболеваний, применяются одновременно все виды лабораторных исследований: культуральный, выявление НК и АГ возбудителя.
Особенности интерпретации результатов лабораторных исследований. О-антигенная характеристика изолята E. coli не во всех случаях четко коррелирует с наличием у него факторов вирулентности, определяющим принадлежность к одной из шести групп диарогенных эшерихий.
Прямыми критериями отнесения E. coli к патогенетическим группам являются ключевые факторы вирулентности, наиболее охарактеризованные из которых представлены ниже.
Для EHEC – продукция шигаподобных токсинов (веротоксинов) 1 и/или 2 типа, в сочетании с наличием интимина (eae-ген) или без него; ЕТЕС – продукция термостабильного (ST) или термолабильного (LT) токсинов, ЕРЕС – наличие так называемого А/Е (attaching and effacing) эффекта, обеспечиваемого интимином (eae – ген) при отсутствии генов шигаподобных токсинов, EIEC- наличие плазмидных генов факторов вирулентности (inv, ipa и др.), EAgEC – наличие плазмидных генов факторов вирулентности aggR, aspU, DAEC – afa – afimbrial factors adhesins, daa – DAEC F1845 fimbriae и др.
Источник