Методы микробиологической диагностики дисбактериоза

Методы микробиологической диагностики дисбактериоза thumbnail

Оглавление темы “Нормальная микрофлора человека. Дисбактериоз. Влияние на микробы факторов внешней среды.”:

1. Круговорот серы. Сульфатное дыхание бактерий. Диссимиляционная сульфатредукция.

2. Круговорот фосфора. Обмен фосфора. Роль бактерий в круговороте фосфора.

3. Нормальная микрофлора человека. Микрофлора человека.

4. Основные микробные биотопы миклофлоры человека. Нормальная Микрофлора полости рта человека. Микрофлора полости рта.

5. Нормальная Микрофлора кожи человека. Микрофлора кожи. Нормальная Микрофлора дыхательной системы. Микрофлора дыхательной системы.

6. Нормальная Микрофлора мочеполовой системы. Микрофлора мочеполовых органов. Нормальная Микрофлора желудочно-кишечного тракта. Микрофлора жкт.

7. Нормальная микрофлора. Роль нормальной микрофлоры человека. Микрофлора и организм.

8. Дисбактериоз. Дисбиоз микрофлоры. Диагностика дисбактериоза. Показания для бактериологической диагностики дисбактериоза кишечника.

9. Влияние на микробы физических факторов внешней среды. Температура. Мезофильные виды бактерий. Термофильные виды. Психрофильные виды.

10. Воздействие температуры на микробы. Стерилизация. Пастеризация. Стерилизация сухим жаром. Автоклавирование. Тиндализация.

11. Высушивание микробов. Лиофилизация. Излучение ( облучение ) микроорганизмов. Воздействие осмотического давления на бактерии. Фильтрование бактерий.

12. Воздействие химических факторов на бактерии. Дезинфектанты. Антисептики.

Дисбактериоз. Дисбиоз микрофлоры. Диагностика дисбактериоза. Показания для бактериологической диагностики дисбактериоза кишечника.

На состав микробных сообществ полостей организма влияют различные факторы: состав и качество пищи, курение и употребление алкоголя, нормальная перистальтика и своевременное опорожнение кишечника и мочевого пузыря, качество пережёвывания пищи и даже характер трудовой деятельности (сидячий или иной). Наибольшее воздействие оказывают заболевания, связанные с изменениями физико-химических свойств эпителиальных поверхностей (например, синдром мальабсорбции), и приём антимикробных препаратов широкого спектра, действую- ] щих на любые, в том числе непатогенные микроорганизмы. В результате выживают более устойчивые виды — стафилококки, кандиды и грамотрицательные палочки (энтеробактерии, псевдомонады). Следствие этого — стойкие нарушения микробных ценозов — дисбактериозы, или дисбиозы. Наиболее тяжёлые формы дисбактериозов — стафилококковый сепсис, сие- ! темный кандидоз и псевдомембранозный колит; среди всех форм доминируют поражения микрофлоры кишечника.

Показания для бактериологической диагностики дисбактериоза кишечника: длительно протекающие инфекции и расстройства, при которых не удаётся выделить патогенные энтеробактерии; затяжной период реконвалесценции после перенесённой кишечной инфек- ции; дисфункции ЖКТ на фоне или после проведённой антибиотикотерапии или у лиц, постоянно контактирующих с антимикробными препаратами. Исследования также следует проводить при болезнях злокачественного роста, у страдающих диспептическими расстройствами, лиц, подготавливаемых к операциям на органах брюшной полости, недоношенных или травмированных новорождённых, а также при наличии бактериемии и гнойных процессов, трудно поддающихся лечению (язвенные колиты и энтероколиты, пиелиты, холециститы и др.).

Посевы изучают на наличие патогенных микроорганизмов и на нарушение соотношения различных видов микробов. Результаты исследования следует считать объективными при анализе роста изолированных колоний в том случае, если можно изучить морфологию и подсчитать количество колоний на чашку Пётри. После идентификации проводят пересчёт содержания микроорганизмов каждого вида на 1 г исследуемого материала. При обнаружении патогенной микрофлоры необходимо изучить ее чувствительность к антибактериальным препаратам и бактериофагам. При определении чувствительности следует отдавать предпочтение антибиотикам узкого спектра для возможно более направленного подавления патогенов.

• К оценке результатов следует подходить осторожно, поскольку состав кишечной микрофлоры варьирует. Необходимо отличать истинный дисбактериоз от дисбактериаяьнъа реакций {сдвиги в составе микрофлоры незначительны, либо кратковременны и не требуют специфической коррекции). При истинном дисбактериозе нарушения микробного ценоза обычно коррелируют с клиническими проявлениями, и их нормализация достаточно длительна (20-30 сут). При оценке результатов следует указать наличие или отсутствие патогенной микрофлоры и дать состав присутствующих микроорганизмов.

Повторные исследования при дисбактериозе. Следует отразить положительную или отрицательную динамику изменения в составе микробных сообществ.

Коррекция дисбактериозов. Для коррекции дисбактериозов следует применять эубиотики — взвеси бактерий, способные восполнить численность недостающих или дефицитных видов. В отечественной практике широко применяют бактерийные препараты в виде высушенных живых культур различных бактерий, например, коли-, лакто- и бифидобактерины (содержащие соответственно Escherichia coli, виды Lactobacillus и Bifidobacterium), бификол (содержащий | виды Bifidobacterium и Escherichia coli), бактисубтил (культура Bacillus subtilis) и др.

норма анализа на дисбактериоз

– Также рекомендуем “Влияние на микробы физических факторов внешней среды. Температура. Мезофильные виды бактерий. Термофильные виды. Психрофильные виды.”

Источник

[10-065]
Дисбактериоз кишечника

1550 руб.

Микробиологическое исследование, которое позволяет оценить состав микрофлоры кишечника – концентрацию и соотношение “полезных”, условно-патогенных и патогенных микроорганизмов в кале, определить специфическую активность основных пробиотиков в отношении выявленных микроорганизмов и их чувствительность к бактериофагам и антибиотикам. К нормальной микрофлоре кишечника (“полезные” бактерии) относятся лактобактерии, бифидобактерии, энтерококки, кишечные палочки (типичные), анаэробная флора (бактероиды). Условно-патогенная флора – это энтеробактерии, неферментирующие бактерии, стафилококки, анаэробные бактерии (клостридии), грибы. Патогенными микроорганизмами являются сальмонеллы, шигеллы, патогенные эшерихии. При выявлении патогенных и/или условно-патогенных микроорганизмов будет определена их чувствительность к антимикробным препаратам (антибиотикам и бактериофагам) и пробиотикам. При обнаружении микроорганизмов, составляющих нормальную микрофлору, чувствительность к антибиотикам и бактериофагам не определяется, т.к. не имеет диагностического значения.

Синонимы русские

Дисбиоз кишечника, определение пробиотиков-антагонистов.

Синонимы английские

Intestinal dysbiosis, antagonistic activity of probiotics and bacteriophage sensitivity test, Intestinal dysbacteriosis.

Метод исследования

Микробиологический метод.

Какой биоматериал можно использовать для исследования?

Кал.

Как правильно подготовиться к исследованию?

  • Исследование рекомендуется проводить до начала приема антибиотиков и других антибактериальных химиотерапевтических препаратов.
  • Исключить прием слабительных препаратов, введение ректальных свечей, масел, ограничить (по согласованию с врачом) прием медикаментов, влияющих на перистальтику кишечника (белладонна, пилокарпин и др.), и препаратов, влияющих на окраску кала (железо, висмут, сернокислый барий), в течение 72 часов до сбора кала.

Общая информация об исследовании

Дисбактериоз (дисбиоз) кишечника – это нарушение состава и количественного соотношения бактериальных и грибковых микроорганизмов желудочно-кишечного тракта. В норме слизистая оболочка ЖКТ является средой обитания так называемых комменсальных микроорганизмов, обеспечивающих целый ряд защитных функций в обмен на микронутриенты, используемые человеком. Большинство кишечных комменсалов относятся к родам Lactobacillus, Bifidobacterium и Bacteroides (облигатные бактерии), хотя состав и количество микроорганизмов сильно варьируются в зависимости от отдела ЖКТ. Так, желудок характеризуется наименьшей плотностью бактерий, среди которых преобладают Lactobacillus, Streptococcus и Helicobacter pylori. В тонкой кишке обнаруживается до 103-106 КОЕ/мл бактерий, преимущественно Streptococcus и Lactobacillus. Наибольшая плотность комменсальных микроорганизмов наблюдается в толстой кишке (108-109 КОЕ/мл), где преобладают Bacteroides, Clostridium, Fusobacterium и Bifidobacterium. Комменсальные микроорганизмы находятся в динамическом взаимодействии с кишечным эпителием и, таким образом, являются механическим препятствием для инвазии патогенов. Кроме того, они секретируют ряд противомикробных соединений (например, дефензины). Бактерии-комменсалы способны регулировать иммунный ответ слизистых оболочек кишечника и в некоторых случаях подавлять воспалительные, в том числе аллергические, реакции. Нарушение баланса микробиоты возникает в результате длительного или бесконтрольного лечения антибактериальными препаратами, при нарушении моторики ЖКТ (послеоперационный период, прием слабительных препаратов), мальабсорбции (хронический алкоголизм, хронический панкреатит) и при некоторых других состояниях. Дисбактериоз может приводить к развитию заболеваний ЖКТ и других органов. Так, в настоящее время получены данные о его роли в патогенезе болезни Крона, неспецифического язвенного колита и целиакии, а также синдрома хронической усталости и атопического дерматита.

Основным способом диагностики дисбактериоза является микробиологический метод, при котором производят качественную и количественную оценку облигатных, условно-патогенных и патогенных микроорганизмов в кале. На основании результатов исследования делают вывод о дефиците облигатных микроорганизмов или об избыточном росте условно-патогенных или патогенных бактерий. Микробиологическое исследование – это один из наиболее специфических и чувствительных методов исследования, применяемых при диагностике дисбактериоза. Следует, однако, помнить, что бактериологический состав кала (он используется в качестве биоматериала) несколько отличается от бактериологического состава слизистой оболочки кишки. Кроме того, результат теста может зависеть от многих других факторов, таких как недавнее употребление антибактериальных препаратов, продуктов, богатых пробиотиками, или слабительных средств.

С учетом растущей устойчивости условно-патогенных и патогенных микроорганизмов к антибактериальным препаратам все большую роль в терапии дисбактериоза играют альтернативные методы лечения с помощью пробиотиков. Пробиотики – это группа препаратов, содержащих бактерии-комменсалы, или дрожжевые грибы. Считается, что они защищают организм от избыточной условно-патогенной и патогенной микробиоты. Совокупность защитных свойств пробиотиков в отношении какого-либо микроорганизма называется антагонистической активностью и может быть определена с помощью микробиологического исследования. В ходе анализа оценивается антагонистическая активность основных используемых в гастроэнтерологической практике пробиотиков. Определение антагонистической активности пробиотиков проводят перед назначением указанных препаратов для лечения дисбактериоза. Оно может быть дополнено анализом на чувствительность выявленных микроорганизмов к антибиотикам и бактериофагам.

Результат анализа оценивают с учетом дополнительным лабораторных и инструментальных данных.

Для чего используется исследование?

  • Для диагностики и лечения дисбактериоза кишечника, контроля его лечения;
  • чтобы установить причины кишечных расстройств;
  • для подбора рациональной терапии антибиотиками.

Когда назначается исследование?

  • При обследовании пациента после длительного курса лечения антибактериальными препаратами;
  • при обследовании пациента с указанием на бесконтрольный прием антибактериальных препаратов и слабительных средств в анамнезе;
  • при выявлении устойчивости условно-патогенных и патогенных микроорганизмов к антибактериальным препаратам;
  • при обследовании пациента с хроническим панкреатитом, хроническим алкоголизмом и другими состояниями, сопровождающимися мальабсорбцией;
  • при хронической диарее;
  • после долгого лечения антибиотиками, глюкокортикостероидами, иммунодепрессантами, химиотерапевтическими препаратами;
  • при аллергических заболеваниях, которые плохо поддаются лечению (например, атопическом дерматите);
  • после воздействия химических веществ или ионизирующей радиации – если есть симптомы дисфункции кишечника;
  • при длительном периоде выздоровления после острых кишечных инфекций.

Что означают результаты?

Виды микроорганизмов

Возраст, годы

Меньше 1

1-60

Старше 60

Бактероиды

107– 108

109- 1010

1010- 1011

О дисбактериозе кишечника свидетельствует:

  • увеличение количества одного или нескольких видов условно-патогенных микроорганизмов при нормальном количестве бифидобактерий в кишечнике,
  • увеличение одного или нескольких видов условно-патогенных микроорганизмов при умеренном снижении количества бифидобактерий (на 1-2 порядка – до 107-108 КОЕ/г),
  • снижение содержания представителей облигатной микрофлоры (бифидобактерий и/или лактобацилл) без увеличения количества сапрофитной или условно-патогенной микрофлоры кишечника,
  • умеренное или значительное (7 КОЕ/г) снижение количества бифидобактерий в сочетании с выраженным уменьшением количества лактобацилл, появлением изменённых форм кишечной палочки, выявлением одного или нескольких представителей условно-патогенных микроорганизмов в высоких титрах (до 107-108 КОЕ/г).

Что может влиять на результат?

  • Антибактериальная терапия или терапия пробиотиками.



Также рекомендуется

  • Копрограмма

Кто назначает исследование?

Врач общей практики, гастроэнтеролог, педиатр, инфекционист.

Литература

  • Chan BK, Abedon ST, Loc-Carrillo C. Phage cocktails and the future of phage therapy. Future Microbiol. 2013 Jun;8(6):769-83.
  • Hütt P, Shchepetova J, Lõivukene K, Kullisaar T, Mikelsaar M. Antagonistic activity of probiotic lactobacilli and bifidobacteria against entero- and uropathogens. J Appl Microbiol. 2006 Jun;100(6):1324-32.
  • Robles Alonso V, Guarner F. Linking the gut microbiota to human health. Br J Nutr. 2013 Jan;109 Suppl 2:S21-6. Review.
  • Hardy H, Harris J, Lyon E, Beal J, Foey AD. Probiotics, prebiotics and immunomodulation of gut mucosal defences: homeostasis and immunopathology. Nutrients. 2013 May 29;5(6):1869-912.

Источник

Код 124.0.
Кал

Этот анализ принимается по сокращённому графику. Это связано с тем, что биоматериал должен попасть в лабораторию в очень короткий срок. Проверьте расписание сокращённого графика приёма на странице вашего отделения

  • Приём, исследование биоматериала
  • Показания к назначению
  • Описание

Приём и исследование биоматериала

Приём материала

  • Можно сдать в отделении Гемотест
  • Можно сдать анализ дома

Метод исследования

Микробиологический

Когда нужно сдавать анализ Микробиологическая диагностика дисбактериоза кишечника?

  • Диарея.
  • Атопический дерматит, хроническая диарея, поражения кишечника из-за действия ионизирующей радиации или химических веществ.
  • Длительный период восстановления после кишечных инфекций.
  • Длительно протекающие кишечные расстройства, при которых не удается выделить патогенные микроорганизмы.
  • Дисфункция кишечника у пациентов, подвергавшихся длительному воздействию радиации, химических веществ и т. п., интенсивной антибиотико- и/или иммунодепрессивной, химио- и гормональной терапии.
  • Наличие бактериемии, гнойно-воспалительных очагов, трудно поддающихся лечению (пиелиты, холециститы, язвенный колит, энтероколит, вялотекущие пневмонии).
  • Проведенное хирургическое лечение при наличии факторов риска развития дисбактериоза кишечника.

Подробное описание исследования

Исследование кала на дисбактериоз проводится микробиологическим методом. Используется для оценки состояния микрофлоры кишечника, выявления причины диареи.

Исследование кала на дисбактериоз кишечника позволяет оценить состав микрофлоры и выявить в нем отклонения, а также разработать индивидуальный план терапии.

Дисбактериоз — это изменение качественного и количественного состава микробиоценоза кишечника. К этому состоянию могут приводить разные причины:

  • изменение характера питания;
  • воспалительные процессы;
  • длительная антибиотикотерапия;
  • хирургическое лечение;
  • длительный стресс;
  • иммунодефицит;
  • проживание в нехарактерной климатической зоне (высокогорье, Арктика).

Нормальные бактерии ЖКТ:

  • бифидобактерии;
  • лактобактерии;
  • типичные формы кишечной палочки;
  • энтерококки;
  • бактероиды (анаэробы).

Кроме «полезных» бактерий, в кишечнике существует условно-патогенная флора. Эти микроорганизмы в норме могут присутствовать в биотопе, но увеличение их количества влечет за собой изменение соотношения микроорганизмов в биоценозе прямой кишки и может приводить к клиническим проявлениям дисбактериоза. К таким микроорганизмам относятся:

  • неферментирующие бактерии;
  • грибки;
  • энтеробактерии;
  • клостридии;
  • стафилококки.

В норме не обнаруживаются, но при заболеваниях встречаются патогенные бактерии. В их число входят:

  • патогенные эшерихии;
  • шигеллы;
  • сальмонеллы.

Исследование позволяет определить характер изменений микрофлоры кишечника и выявить патологию, которая привела к ее развитию.

Что ещё назначают с этим исследованием?

Использованная литература

  1. Методические рекомендации «Бактериологическая диагностика дисбактериоза кишечника», утв. Минздравом РСФСР — 1977.
  2. Отраслевой стандарт «Протокол ведения больных дисбактериозом кишечника». ОСТ 91500.11.0004-2003.
  3. Определение дисбиотических изменений желудочно-кишечного тракта по маркѐрам содержимого кишечника. Федеральные клинические рекомендации — 2005.
  4. Клинические рекомендации национальной ассоциации специалистов по контролю инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи и общероссийской общественной некоммерческой организации «ассоциации колопроктологов России» по диагностике, лечению и профилактике Clostridium difficile-ассоциированной диареи (CDI) — 2017.
  5. Chan BK, Abedon ST, Loc-Carrillo C. Phage cocktails and the future of phage therapy. Future Microbiol. 2013 Jun;8(6):769-83.
  6. Robles Alonso V, Guarner F. Linking the gut microbiota to human health. Br J Nutr. 2013 Jan;109 Suppl 2:S21-6. Review.
  • Подготовка к исследованию
  • Противопоказания и ограничения

Подготовка к исследованию

  • За 14 дней до анализа необходимо прекратить прием антибиотиков.
  • За 72 часа до исследования — отказаться от использования ректальных свечей и масел, слабительных средств и клизм, приема препаратов, оказывающих влияние на работу кишечника и окраску кала.
  • Биоматериал не должен содержать примеси мочи и воды. Нельзя собирать кал с памперсов, из горшков, медицинского судна, унитаза.

Противопоказания и ограничения

Абсолютных противопоказаний нет.
Факторы, влияющие на результат исследования:

  • прием лекарственных средств с антимикробной активностью;
  • прием препаратов, изменяющих перистальтику кишечника и цвет кала.
  • Интерпретация результата
  • Референсные значения

Интерпретация результата

Анализ на дисбактериоз кишечника показывает:

  • повышение количества условно-патогенных бактерий на фоне нормального числа бифидобактерий;
  • рост титра условно-патогенной флоры с падением концентрации бифидобактерий до 107–108 КОЕ/г;
  • уменьшение числа лакто- и бифидобактерий без повышения концентрации условно-патогенных бактерий или сапрофитов;
  • снижение количества бифидобактерий с одновременным массовым уменьшением числа лактобацилл, появлением кишечной палочки атипичной формы, обнаружением высоких титров условно-патогенной флоры (до 107–108 КОЕ/г).

Диагноз «дисбактериоз кишечника» основывается на результатах клинического обследования пациента и данных микробиологического исследования кала.

Следует учитывать динамическое изменение микробиоценоза толстого кишечника в зависимости от многих параметров состояния организма, в том числе и от состава пищи. Биоматериал одного пациента, полученный в разное время, не всегда будет идентичен по составу и количеству выделенных микроорганизмов.

Референсные значения

  • Микрофлора Результат Bifidobacterium (бифидобактерии): 10*9–10*10
  • Lactobacillus (лактобактерии): 10*7–10*8
  • E.coli (кишечная палочка с нормальной ферментативной активностью): 10*7–10*8
  • E.coli (кишечная палочка со сниженной ферментативной активностью): <10*5
  • E.coli (лактозонегативная кишечная палочка): </=10*5
  • E.coli (гемолизирующая кишечная палочка): 0
  • Enterococcus (энтерококки): 10*5-10*8
  • Микробы рода Proteus (протей): </=10*4
  • Klebsiella (клебсиелла): </=10*4
  • Enterobacteriaceae (энтеробактерии): Hafnia (гафния), Serratia (серрация), Citrobacter (цитробактер) и другие: </=10*4
  • Еnterobacter (энтеробактер): </=10*4
  • Staphylococcus aureus (стафилококк золотистый): 0
  • Staphylococcus epidermidis (стафилококк эпидермальный): </=10*4
  • Грибы рода Candida (кандида) и другие дрожжевые грибы: </=10*4
  • Неферментирующие грамотрицательные бактерии: </=10*4

Источник

Читайте также:  Дисбактериоз чем лечить гинекология какие свечи