Му диагностика вспышки острых кишечных инфекций

[09-134]
Острые кишечные инфекции, скрининг (Shigella spp., E. coli (EIEC), Salmonella spp., Campylobacter spp., Adenovirus F, Rotavirus A, Norovirus 2 генотип, Astrovirus)

1920 руб.

Комплексное молекулярно-генетическое исследование, которое позволяет выявить генетический материал наиболее вероятных возбудителей острых кишечных инфекций в кале и установить этиологию заболевания.

Синонимы русские

ОКИ, ПЦР (кал).

Синонимы английские

Acute intestinal infection screening; Bacterial and viral diarrhea screening, PCR, fecal samples.

Метод исследования

Полимеразная цепная реакция в режиме реального времени.

Какой биоматериал можно использовать для исследования?

Кал.

Как правильно подготовиться к исследованию?

Исследование рекомендуется проводить до начала приема антибиотиков и других антибактериальных химиотерапевтических препаратов.
Исключить прием слабительных препаратов, введение ректальных свечей, масел, ограничить прием медикаментов, влияющих на перистальтику кишечника (белладонна, пилокарпин и др.) и на окраску кала (железо, висмут, сернокислый барий), в течение 72 часов до сбора кала.

Общая информация об исследовании

Острые кишечные инфекции (ОКИ) – группа заболеваний, обусловленных вирусами, бактериями или паразитами, для которых характерен фекально-оральный механизм передачи. Общими для данных инфекций являются факторы передачи: пищевые продукты, вода, инфицированные бытовые предметы и грязные руки. Первые симптомы возникают через несколько часов или дней после инфицирования, начало резкое, с появлением частого жидкого стула, рвоты, боли в животе, признаков интоксикации (лихорадки, озноба, тошноты). Заболевание может носить групповой характер и проявиться у нескольких человек, употреблявших инфицированную пищу или воду.

Согласно официальной статистике, в России до 65-67% заболеваний этой группы составляют ОКИ неуточненной этиологии. Если возбудитель инфекции неизвестен, эффективность противоэпидемических мероприятий ограничивается. Соотношение частоты выявления вирусных и бактериальных патогенов варьируется в разных возрастах: у детей до 3 лет на долю вирусных агентов приходится 80-90% заболеваний, на долю бактериальных – 10-20%; среди взрослых пациентов доля вирусных возбудителей снижается до 30%.

Shigella species и Esherichia coli – грамотрицательные палочковидные микроорганизмы из семейства энтеробактерий. К роду Shigella относятся патогенные бактерии S. dysenteriae, S. flexneri, S. boydii и S. sonnei, которые являются возбудителями шигеллеза (бактериальной дизентерии). Энтероинвазивные E. coli (EIEC) очень близки с шигеллами, синтезируют и выделяют шигеллоподобный токсин, способны проникать в клетки слизистой кишечника и разрушать энтероциты, что приводит к образованию язвенных дефектов в слизистой кишечника. За значительную часть случаев “бактериологически неподтвержденной дизентерии”, особенно у детей, ответственен энтероинвазивный эшерихиоз.

Бактерии рода Salmonella относятся к семейству энтеробактерий. S. typhi и S. parathyphi являются возбудителями брюшного тифа и паратифа. Существует множество серовариантов Salmonella species, способных вызвать у человека инфекцию по типу гастроэнтероколита, а также стать причиной внутрибольничных инфекций. Сальмонеллез может протекать в форме острой кишечной инфекции, тяжелой генерализированной инфекции или бессимптомного носительства. Окончательный диагноз ставится только после выделения возбудителя или обнаружения его ДНК.

Кампилобактерии являются одними из наиболее сложных для культивирования (которое требуется в ходе анализа) микроорганизмов. Это объясняется их микроаэрофильностью и возможностью подавления их роста сопутствующей флорой. Род кампилобактерий объединяет как возбудителей ОКИ (термофильные виды), так и сапрофитные и условно-патогенные виды, о чем необходимо помнить при выявлении этих микроорганизмов в клиническом материале. Применение наборов на основе ПЦР для определения термофильной группы кампилобактерий позволяет не только избежать трудоемкой и высокозатратной бактериологической работы, но и четко ограничить детекцию тех видов кампилобактерий, которые имеют этиологическую связь с острой кишечной инфекцией (С. jejuni, C. coli, C. lari, C. upsaliensis).

В соответствии с данными зарубежной литературы, норовирус – наиболее частый возбудитель вспышек ОКИ небактериальной этиологии. Эта особенность связана с низкой инфицирующей дозой и высокой устойчивостью в окружающей среде. ПЦР является “золотым стандартом” в клинической диагностике норовирусных инфекций.

Несмотря на несколько меньшую в сравнении с рота- и норовирусами распространенность, астровирусы составляют значительный пласт кишечных инфекций, у трети пациентов протекающий с явлениями колита. Ротавирусы группы А являются наиболее частой причиной спорадических заболеваний ОКИ у детей, а ДНК-содержащий аденовирус F (серотипы 40 и 41) нередко вызывает вспышки гастроэнтеритов у детей младшего возраста.

Для выявления и дифференциальной диагностики кишечных инфекций используются культуральные и молекулярно-генетические методы исследования генетического материала возбудителя в кале и определение концентрации специфических иммуноглобулинов в крови. ПЦР обладает преимуществом перед культуральными методами благодаря быстрому получению результатов, высокой специфичности и чувствительности исследования. Данный анализ позволяет со 100-процентной точностью определить возбудителя кишечного заболевания, а быстрая диагностика острых кишечных инфекций помогает избежать лишних процедур и оперативных вмешательств, своевременно начать лечение и ограничить очаг распространения инфекции.

Для чего используется исследование?

Для установления этиологического фактора острой кишечной инфекции;
для дифференциальной диагностики причин острого гастроэнтероколита (воспаления ЖКТ).

Когда назначается исследование?

При симптомах острого гастроэнтерита, вероятно, инфекционной этиологии (жидкий частый стул, рвота, лихорадка, боли в животе);
при одновременном или последовательном развитии ОКИ у нескольких членов семьи, у детей в детском учреждении или пациентов в стационаре;
при подозрении на развитие внутрибольничной кишечной инфекции (при обострении симптомов энтероколита у пациента, находящегося на лечении по поводу ОКИ).

Что означают результаты?

Референсные значения: отрицательно.

Причины положительного результата:

присутствие ДНК или РНК возбудителя ОКИ; этиология в зависимости от выявленного вида возбудителя (Shigella spp., E. coli (EIEC), Salmonella spp., Campylobacter spp., Adenovirus F, Rotavirus A, Norovirus (2-й генотип), Astrovirus).

Причины отрицательного результата:

отсутствие инфицирования Shigella spp., E. coli (EIEC), Salmonella spp., Campylobacter spp., Adenovirus F, Rotavirus A, Norovirus (2-й генотип), Astrovirus.

Важные замечания

Рекомендуется проводить исследование в первые 3 суток с начала заболевания, у госпитализированных пациентов – в первый день госпитализации.
Важно помнить, что острый энтероколит может быть обусловлен и другими инфекциями (например, амебами, лямблиями, иерсиниями, клостридиями, протеями и др.) или неинфекционными причинами (токсинами, ядовитыми веществами, острой непроходимостью кишечника, тромбозом сосудов брыжейки, воспалительными заболеваниями кишечника, острым панкреатитом, аппендицитом, целиакией, острым гепатитом, мальабсорбцией, дивертикулитом).

Также рекомендуется

Yersinia pseudotuberculosis, ДНК [ПЦР]
anti-Shigella flexneri 1-5, anti-Shigella flexneri 6, anti-Shigella sonnei
Посев кала на патогенную флору (диз. группа и тифо-паратифозная группа)
Посев кала на условно-патогенную флору с определением чувствительности к антибиотикам
Анализ кала на цисты простейших
Копрограмма
Общий анализ крови (без лейкоцитарной формулы и СОЭ)
Лейкоцитарная формула
Скорость оседания эритроцитов (СОЭ)

Кто назначает исследование?

Инфекционист, гастроэнтеролог, терапевт, педиатр.

Литература

Борисов Л. Б. Медицинская микробиология, вирусология, иммунология. М.: МИА, 2005. – 736 с.
Gómez-Duarte O., Bai J., Newel E. Detection of E. coli, Salmonella spp., Shigella spp., Yersinia enterocolitica, Vibrio cholerae, and Campylobacter spp. enteropathogens by Three-reaction Multiplex PCR. Diagn Microbiol Infect Dis. 2009 January; 63(1): 1-9. PMCID: PMC2701628.

Источник

Диагностика острой кишечной инфекции. Выявление причины кишечной инфекции

Для точной этиологической диагностики острой кишечной инфекции решающим является обнаружение возбудителя в рвотных массах, промывных водах желудка, испражнениях и остатках пищи, подозреваемой в качестве фактора заражения. Очень важно как можно раньше взять материал для бактериологического исследования. При спорадических кишечных инфекциях, вызываемых условно-патогенными бактериями , в связи с частым обитанием последних в кишечнике человека и развитием дисбактериоза находки их только в фекалиях не могут иметь диагностического значения: этиологически доказательным участие УПБ становится только при их преобладающем росте в остром периоде болезни и уменьшении их количества ко времени выздоровления.

При сальмонеллезах достоверным является обнаружение возбудителя в фекалиях, моче и крови Посев крови на гемокультуру следует проводить на протяжении всего лихорадочного периода. Посевы промывных вод желудка оправданы при использовании для промывания желудка физиологического раствора, кипяченой воды, но не раствора перманганата калия или соды. Большая частота посевов исследуемого материала в начале болезни повышает процент положительных результатов. Посуду для взятия материала стерилизуют кипячением. Полученный материал без промедления доставляют в бактериологическую лабораторию, где немедленно проводят посевы.

Набор питательных сред должен быть максимально широким, позволяющим выделять различные виды возбудителей кишечной инфекции. При отсутствии роста патогенных бактерий оправданы вирусологические исследования. Уточнение этиологии вирусных диарей важно в случаях их массового возникновения. При направлении материала следует указать клинический диагноз и наиболее яркие клинические симптомы у данного больного, что важно для целенаправленного поиска возбудителя. Поиск возбудителей кишечных заболеваний даже в условиях хорошо оснащенных современных бактериологических лабораторий все еще малорезультативен.

боль при кишечной инфекции

Этиологическая расшифровка острой кишечной инфекции не выходит за рамки 40-60%. Во время эпидемических и крупных локальных вспышек ОКИ показатель бактериологического подтверждения диагноза несколько возрастает, но никогда не достигает 100%. В нозологической расшифровке диарейных заболеваний огромная роль принадлежит всестороннему клиническому обследованию больного Решающее значение порой имеют не данные лабораторных анализов, включая обнаружение или отсутствие того или иного возбудителя, а результаты клинического течения болезни, которые позволяют врачу самостоятельно сформулировать диагноз.

Помимо бактериологического исследования, необходима серологическая диагностика. При сальмонеллезах хорошо зарекомендовала себя реакция непрямой гемагглютинации (РНГА)с сальмонеллезными эритроцитарными диагностикумами. При пищевой токсикоинфекции, вызванных УПБ, используется реакция агглютинации с аутоштаммами возбудителей (кровь берут в разгар заболевания и через 5-7 дней от начала болезни), но результаты ее малодостоверны. Наблюдаются случаи, когда выделение шигелл и сальмонелл у больных неспецифическим язвенным колитом (НЯК) и другими болезнями кишечника, особенно онкозаболеваниями, продолжается многие недели и даже месяцы.

Это не должно быть основанием для обязательной постановки во всех случаях диагноза хронической дизентерии или сальмонеллеза Вегетированию экзогенных бактерий в этих случаях способствует наличие некротических масс в кишечном содержимом при непрерывно текущем хроническом воспалении (нозопаразитизм патогенных бактерий). Однократный высев сальмонелл и даже шигелл у больных колитами другой этиологии может быть транзиторным бактериовыделением или постинфекционным бактерионосительством. Таким образом, клиническая диагностика всегда должна быть решающей.

– Также рекомендуем “Инфаркт миокарда с клиникой кишечной инфекции. Гипертонический криз и токсикоинфекция”

Оглавление темы “Современное выявление острой кишечной инфекции”:

1. Диагноз острой кишечной инфекции. Пищевая токсикоинфекция

2. Дифференциация пищевой токсикоинфекции (ПТИ). Дифференцировка острой дизентерии

3. Формы пищевой токсикоинфекции. Причины пищевой токсикоинфекции

4. Редкие формы токсикоинфекций. Соматическая патология с клиникой токсикоинфекции

5. Кишечный сепсис. Дифференциация ботулизма и пищевой токсикоинфекции

6. Дифференциация вирусных поражений и пищевых токсикоинфекций. Пищевые интоксикации – отравления

7. Диагностика острой кишечной инфекции. Выявление причины кишечной инфекции

8. Инфаркт миокарда с клиникой кишечной инфекции. Гипертонический криз и токсикоинфекция

9. Острый живот и кишечные инфекции. Основные причины диареи

10. Наследственные причины диареи. Синдромы сопровождающиеся диареей

Источник

БАКТЕРИОСКОПИЯ

Работа № 1. Морфологические и тинкториальные свойства возбудителей ОКИ.

Цель: изучить морфологические и тинкториальные свойства ОКИ, вызванных ЭПКП, шигеллами, иерсиниями.

Самостоятельная работа: микроскопировать готовые препараты – мазки, зарисовать.

Сделать вывод.

А) эшерихии

Результат_______________________________________________________________________________________________________________

Б) шигеллы

Результат:___________________________________________________

__________________________________________________________

В) иерсинии

Результат:________________________________________________

__________________________________________________________

Вывод:__________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________

БАКТЕРИОЛОГИЯ

Работа № 2. Культуральные свойства возбудителей ОКИ

Цель:изучитькультуральные свойства ЭПКП, шигелл, иерсиний.

Самостоятельная работа: зарегистрировать характер роста ЭПКП, шигелл, иерсиний на основных и дифференциально-диагностических питательных средах. Зарисовать. Сделать вывод.

Среда МПА (основная среда)

А) ЭПКП__________________________________________________________

Б) шигеллы________________________________________________________

В) иерсинии_______________________________________________________

Вывод:____________________________________________________________

__________________________________________________________________

Среда Эндо (ДДС)

А) ЭПКП________________________________________________________

Б) шигеллы_______________________________________________________

В)иерсинии_______________________________________________________

Вывод:__________________________________________________________

________________________________________________________________

Среда Левина (ДДС)

А) ЭПКП__________________________________________________________

Б) шигеллы________________________________________________________

В) иерсинии_______________________________________________________

Вывод :___________________________________________________________

_________________________________________________________________

__________________________________________________________________

Среда иерсиниозная (ДДС)

А) ЭПКП__________________________________________________________

Б) шигеллы________________________________________________________

В) иерсинии________________________________________________________

Вывод:____________________________________________________________

__________________________________________________________________

Работа № 3. Биохимическая активность возбудителей ОКИ

См. теоретическую справку

А) Цель: определить род возбудителя по ферментации на среде Клиглера (на плотных средах).

Самостоятельная работа: зарегистрировать характер изменений на плотной питательной среде, наблюдаемых при росте ЭПКП, шигелл, иерсиний, определить род возбудителя. Сделать вывод.

Среда Клиглера (стерильная)

Среда Клиглера ЭПКП Шигеллы Иерсинии

(стерильная)

Вывод:________________________________________________________________________

__________________________________________________________________________________________________________________________________________________________

______________________________________________________________________________

В) Цель: определить вид возбудителя по ферментации на среде Гисса (на жидких средах).

Самостоятельная работа: зарегистрировать характер изменений на жидкой питательной среде, наблюдаемых при росте ЭПКП, шигелл, иерсиний, определить вид возбудителя. Сделать вывод.

ЭПКП

E. coli

Шигелла

S. flexeri

Иерсинии

Y. enterocolitica

Вывод:_______________________________________________________________________

_______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________

Работа № 4. Сероиндикация возбудителей кишечной группы

Цель:определить род возбудителя ОКИ

Самостоятельная работа: поставить РА на стекле для определения рода возбудителя с поливалентными агглютинирующими сыворотками.

Направление:___________________________________________________________________

Ингредиенты:1._________________________________________________________________

2._________________________________________________________________

3._________________________________________________________________

Механизм:

Постановка:

Результат:____________________________________________________________________

____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________

Вывод:_______________________________________________________________________

____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________

Работа № 5. Фаголизабельность и антибиотикорезистентность ОКИ

Цель:изучитьчувствительность к бактериофагам и антибиотикам возбудителей ОКИ

Самостоятельная работа: зарегистрировать фаголизабельные и антибиотикорезистентные свойства ЭПКП.

Чувствительность к фагам:

1 –

2 –

3 –

Чувствительность к антибиотикам:

1 –

2 –

3 –

4 –

5 –

6 –

7 –

Тесты
Культуры ТтКультуры/тес RRКультуры/ntntcns Тесты
Культуры ч

Бактериофаги

Антибиотики

Коли-
протей- ный

Дизе
нтерий
ный

Сальмонеллез-ный

Цефа клор

Лево
мице
тин

Гентам ицин

Доксиц иклин

Тетра
цикл
ин

Рифам пицин

Карбен
ициллин

ЭПКП

Работа № 6. Алгоритм лабораторной диагностики ОКИ

Цель:изучить основные направления и этапы лабораторной диагностики ОКИ

Самостоятельная работа:составить схему лабораторной диагностики ОКИ (см. теоретическую справку, атлас, таблицы).

Принципиальная лабораторная диагностика кишечных инфекций

Исследуемый материал:

____________________

Подпись преподавателя___________________________

Самостоятельная работа студента во внеурочное время:

I.Классифицировать предложенные антимикробные препараты в соответствии с их назначением (диагностические, профилактические, лечебные):

Бактериофаг диагностический дизентерийный Флекснера

2. __________________________________________________________________________

3. __________________________________________________________________________

4. __________________________________________________________________________

5. __________________________________________________________________________

6. __________________________________________________________________________

Сыворотка поливалентная агглютинирующая эшерихиозная

2.____________________________________________________________________________

3.____________________________________________________________________________

4.____________________________________________________________________________

5.____________________________________________________________________________

6.____________________________________________________________________________

Агглютинирующая сыворотка к шигеллам Зонне, Флекснера

2.____________________________________________________________________________

3.____________________________________________________________________________

4.____________________________________________________________________________

5.____________________________________________________________________________

6.____________________________________________________________________________

Бактериофаг поливалентный дизентерийный сухой с кислотным покрытием

2.____________________________________________________________________________

3.____________________________________________________________________________

4.____________________________________________________________________________

5.____________________________________________________________________________

6.____________________________________________________________________________

Дизентерийная люминесцирующая сыворотка Зонне

2._____________________________________________________________________________

3._____________________________________________________________________________

4._____________________________________________________________________________

5._____________________________________________________________________________

6._____________________________________________________________________________

1. Дизентерийный диагностикум 2._____________________________________________________________________________

3._____________________________________________________________________________

4._____________________________________________________________________________

5._____________________________________________________________________________

6._____________________________________________________________________________

Эритроцитарный диагностикум из шигелл Зонне

2._____________________________________________________________________________

3._____________________________________________________________________________

4._____________________________________________________________________________

5._____________________________________________________________________________

6._____________________________________________________________________________

Колипротейный бактериофаг

2._____________________________________________________________________________

3._____________________________________________________________________________

4._____________________________________________________________________________

5._____________________________________________________________________________

6._____________________________________________________________________________

1. Колибактерин 2._____________________________________________________________________________

3._____________________________________________________________________________

4._____________________________________________________________________________

5._____________________________________________________________________________

6._____________________________________________________________________________

1. Полимиксин В, Е 2._____________________________________________________________________________

3._____________________________________________________________________________

4._____________________________________________________________________________

5._____________________________________________________________________________

6._____________________________________________________________________________

II. Заполнить контрольные карты по предложенным нозоформам:

ДИЗЕНТЕРИЯ

Таксономия возбудителя:

Семейство__________________________________________________________________

Род________________________________________________________________________

Вид________________________________________________________________________

Морфологические и тинкториальные свойства________________________________

Культивирование и ферментативные свойства__________________________________

Антигенная структура________________________________________________________

_____________________________________________________________________________

Резистентность_______________________________________________________________

__________________________________________________________________________________________________________________________________________________________

Эпидемиология

Источник инфекции___________________________________________________________

Механизм передачи___________________________________________________________

Пути передачи________________________________________________________________

_____________________________________________________________________________

Факторы передачи_____________________________________________________________

Патогенность для животных___________________________________________________

Патогенез и клиника

Входные ворота_____________________________________________________________

Места первичной локализации_________________________________________________

____________________________________________________________________________

Инкубационный период________________________________________________________

Клинические симптомы________________________________________________________

__________________________________________________________________________________________________________________________________________________________

Основные факторы патогенности ________________________________________________

_____________________________________________________________________________

Основные фазы патогенеза_____________________________________________________

Иммунитет___________________________________________________________________

Лабораторная диагностика_____________________________________________________

Неспецифическая профилактика (мероприятия)_________________________________

Специфическая профилактика (препараты)_____________________________________

_____________________________________________________________________________

Лечение (препараты)_________________________________________________________

__________________________________________________________________________________________________________________________________________________________

ЭШЕРИХИОЗ