Пцр диагностика острых кишечных инфекций
[09-134]
Острые кишечные инфекции, скрининг (Shigella spp., E. coli (EIEC), Salmonella spp., Campylobacter spp., Adenovirus F, Rotavirus A, Norovirus 2 генотип, Astrovirus)
1920 руб.
Комплексное молекулярно-генетическое исследование, которое позволяет выявить генетический материал наиболее вероятных возбудителей острых кишечных инфекций в кале и установить этиологию заболевания.
Синонимы русские
ОКИ, ПЦР (кал).
Синонимы английские
Acute intestinal infection screening; Bacterial and viral diarrhea screening, PCR, fecal samples.
Метод исследования
Полимеразная цепная реакция в режиме реального времени.
Какой биоматериал можно использовать для исследования?
Кал.
Как правильно подготовиться к исследованию?
- Исследование рекомендуется проводить до начала приема антибиотиков и других антибактериальных химиотерапевтических препаратов.
- Исключить прием слабительных препаратов, введение ректальных свечей, масел, ограничить прием медикаментов, влияющих на перистальтику кишечника (белладонна, пилокарпин и др.) и на окраску кала (железо, висмут, сернокислый барий), в течение 72 часов до сбора кала.
Общая информация об исследовании
Острые кишечные инфекции (ОКИ) – группа заболеваний, обусловленных вирусами, бактериями или паразитами, для которых характерен фекально-оральный механизм передачи. Общими для данных инфекций являются факторы передачи: пищевые продукты, вода, инфицированные бытовые предметы и грязные руки. Первые симптомы возникают через несколько часов или дней после инфицирования, начало резкое, с появлением частого жидкого стула, рвоты, боли в животе, признаков интоксикации (лихорадки, озноба, тошноты). Заболевание может носить групповой характер и проявиться у нескольких человек, употреблявших инфицированную пищу или воду.
Согласно официальной статистике, в России до 65-67% заболеваний этой группы составляют ОКИ неуточненной этиологии. Если возбудитель инфекции неизвестен, эффективность противоэпидемических мероприятий ограничивается. Соотношение частоты выявления вирусных и бактериальных патогенов варьируется в разных возрастах: у детей до 3 лет на долю вирусных агентов приходится 80-90% заболеваний, на долю бактериальных – 10-20%; среди взрослых пациентов доля вирусных возбудителей снижается до 30%.
Shigella species и Esherichia coli – грамотрицательные палочковидные микроорганизмы из семейства энтеробактерий. К роду Shigella относятся патогенные бактерии S. dysenteriae, S. flexneri, S. boydii и S. sonnei, которые являются возбудителями шигеллеза (бактериальной дизентерии). Энтероинвазивные E. coli (EIEC) очень близки с шигеллами, синтезируют и выделяют шигеллоподобный токсин, способны проникать в клетки слизистой кишечника и разрушать энтероциты, что приводит к образованию язвенных дефектов в слизистой кишечника. За значительную часть случаев “бактериологически неподтвержденной дизентерии”, особенно у детей, ответственен энтероинвазивный эшерихиоз.
Бактерии рода Salmonella относятся к семейству энтеробактерий. S. typhi и S. parathyphi являются возбудителями брюшного тифа и паратифа. Существует множество серовариантов Salmonella species, способных вызвать у человека инфекцию по типу гастроэнтероколита, а также стать причиной внутрибольничных инфекций. Сальмонеллез может протекать в форме острой кишечной инфекции, тяжелой генерализированной инфекции или бессимптомного носительства. Окончательный диагноз ставится только после выделения возбудителя или обнаружения его ДНК.
Кампилобактерии являются одними из наиболее сложных для культивирования (которое требуется в ходе анализа) микроорганизмов. Это объясняется их микроаэрофильностью и возможностью подавления их роста сопутствующей флорой. Род кампилобактерий объединяет как возбудителей ОКИ (термофильные виды), так и сапрофитные и условно-патогенные виды, о чем необходимо помнить при выявлении этих микроорганизмов в клиническом материале. Применение наборов на основе ПЦР для определения термофильной группы кампилобактерий позволяет не только избежать трудоемкой и высокозатратной бактериологической работы, но и четко ограничить детекцию тех видов кампилобактерий, которые имеют этиологическую связь с острой кишечной инфекцией (С. jejuni, C. coli, C. lari, C. upsaliensis).
В соответствии с данными зарубежной литературы, норовирус – наиболее частый возбудитель вспышек ОКИ небактериальной этиологии. Эта особенность связана с низкой инфицирующей дозой и высокой устойчивостью в окружающей среде. ПЦР является “золотым стандартом” в клинической диагностике норовирусных инфекций.
Несмотря на несколько меньшую в сравнении с рота- и норовирусами распространенность, астровирусы составляют значительный пласт кишечных инфекций, у трети пациентов протекающий с явлениями колита. Ротавирусы группы А являются наиболее частой причиной спорадических заболеваний ОКИ у детей, а ДНК-содержащий аденовирус F (серотипы 40 и 41) нередко вызывает вспышки гастроэнтеритов у детей младшего возраста.
Для выявления и дифференциальной диагностики кишечных инфекций используются культуральные и молекулярно-генетические методы исследования генетического материала возбудителя в кале и определение концентрации специфических иммуноглобулинов в крови. ПЦР обладает преимуществом перед культуральными методами благодаря быстрому получению результатов, высокой специфичности и чувствительности исследования. Данный анализ позволяет со 100-процентной точностью определить возбудителя кишечного заболевания, а быстрая диагностика острых кишечных инфекций помогает избежать лишних процедур и оперативных вмешательств, своевременно начать лечение и ограничить очаг распространения инфекции.
Для чего используется исследование?
- Для установления этиологического фактора острой кишечной инфекции;
- для дифференциальной диагностики причин острого гастроэнтероколита (воспаления ЖКТ).
Когда назначается исследование?
- При симптомах острого гастроэнтерита, вероятно, инфекционной этиологии (жидкий частый стул, рвота, лихорадка, боли в животе);
- при одновременном или последовательном развитии ОКИ у нескольких членов семьи, у детей в детском учреждении или пациентов в стационаре;
- при подозрении на развитие внутрибольничной кишечной инфекции (при обострении симптомов энтероколита у пациента, находящегося на лечении по поводу ОКИ).
Что означают результаты?
Референсные значения: отрицательно.
Причины положительного результата:
- присутствие ДНК или РНК возбудителя ОКИ; этиология в зависимости от выявленного вида возбудителя (Shigella spp., E. coli (EIEC), Salmonella spp., Campylobacter spp., Adenovirus F, Rotavirus A, Norovirus (2-й генотип), Astrovirus).
Причины отрицательного результата:
- отсутствие инфицирования Shigella spp., E. coli (EIEC), Salmonella spp., Campylobacter spp., Adenovirus F, Rotavirus A, Norovirus (2-й генотип), Astrovirus.
Важные замечания
- Рекомендуется проводить исследование в первые 3 суток с начала заболевания, у госпитализированных пациентов – в первый день госпитализации.
- Важно помнить, что острый энтероколит может быть обусловлен и другими инфекциями (например, амебами, лямблиями, иерсиниями, клостридиями, протеями и др.) или неинфекционными причинами (токсинами, ядовитыми веществами, острой непроходимостью кишечника, тромбозом сосудов брыжейки, воспалительными заболеваниями кишечника, острым панкреатитом, аппендицитом, целиакией, острым гепатитом, мальабсорбцией, дивертикулитом).
Также рекомендуется
- Yersinia pseudotuberculosis, ДНК [ПЦР]
- anti-Shigella flexneri 1-5, anti-Shigella flexneri 6, anti-Shigella sonnei
- Посев кала на патогенную флору (диз. группа и тифо-паратифозная группа)
- Посев кала на условно-патогенную флору с определением чувствительности к антибиотикам
- Анализ кала на цисты простейших
- Копрограмма
- Общий анализ крови (без лейкоцитарной формулы и СОЭ)
- Лейкоцитарная формула
- Скорость оседания эритроцитов (СОЭ)
Кто назначает исследование?
Инфекционист, гастроэнтеролог, терапевт, педиатр.
Литература
- Борисов Л. Б. Медицинская микробиология, вирусология, иммунология. М.: МИА, 2005. – 736 с.
- Gómez-Duarte O., Bai J., Newel E. Detection of E. coli, Salmonella spp., Shigella spp., Yersinia enterocolitica, Vibrio cholerae, and Campylobacter spp. enteropathogens by Three-reaction Multiplex PCR. Diagn Microbiol Infect Dis. 2009 January; 63(1): 1-9. PMCID: PMC2701628.
Источник
Акция! Первичный прием врача акушера-гинеколога + УЗИ органов малого таза
Первичный прием врача акушера-гинеколога
Повторный прием врача акушера-гинеколога
Первичный прием врача гинеколога-эндокринолога
Прием врача-кардиолога
Прием врача-терапевта
Первичный прием врача-терапевта кандидата медицинских наук
Повторный прием врача-терапевта кандидата медицинских наук
УЗИ органов малого таза
Прием врача-маммолога
Бесплатная консультация по ведению беременности
УЗИ диагностика беременности
УЗИ в 1 триместре беременности (до 14 недель)
Программа ведения беременности “Стандарт”
Программа планирование беременности: Стандартное обследование
УЗИ-скрининг 2 триместра
УЗИ в 3 триместре беременности (с 29-ой недели)
УЗИ беременности 3D/4D + флешка
Фолликулометрия
КТГ (сердцебиение плода)
Допплеровское исследование кровотока (допплерометрия) во 2-м, 3-ем триместре беременности
Шиллер-тест (тест на выявление заболеваний шейки матки)
Удаление ВМС
pН-метрия влагалища (измерение кислотности)
Постановка ВМС (без стоимости спирали)
УЗИ определение пола плода
Расширенная видеокольпоскопия
УЗИ шейки матки (цервикометрия)
УЗИ молочных желез
УЗИ-определение сердцебиения плода
Комплексное УЗИ брюшной полости (печень, желчный пузырь, поджелудочная железа и селезенка) с ЦДК
УЗИ почек и надпочечников (с ЦДК)
УЗИ в 1 триместре беременности при многоплодной беременности (до 14 недель)
Программа ведения беременности “Эксперт”
Программа планирование беременности: Расширенное обследование
УЗИ во 2 триместре беременности при многоплодной беременности (14-28 недель)
Комплексное УЗИ мочевыделительной системы (почки, мочеточники, мочевой пузырь) с ЦДК
УЗИ щитовидной железы
УЗИ в 3 триместре беременности при многоплодной беременности (с 29-ой недели)
УЗИ беременности 3D/4D + флешка при многоплодной беременности
УЗИ парных суставов (за пару)
КТГ (сердцебиение плодов) при многоплодной беременности
УЗИ мягких тканей (с ЦДК)
Допплеровское исследование кровотока (допплерометрия) во 2-м, 3-ем триместре при многоплодной беременности
ЭКГ (электрокардиограмма) с расшифровкой
Исследование проходимости маточных труб (ЭХОГС, ГСГ)
Лечение шейки матки радиоволновым методом
Удаление папиллом, полипов, кондилом и бородавок радиоволновым методом
Конизация шейки матки
Программа планирование беременности: Минимальное обследование
Биопсия шейки матки
Пайпель-биопсия эндометрия
Местная анестезия
Взятие анализов без консультации врача
Взятие анализов на консультации врача
Первичный прием акушера-гинеколога по беременности
УЗИ вен нижних конечностей
Повторный прием акушера-гинеколога по беременности
УЗИ вен верхних конечностей
Первичный прием ведущего акушера-гинеколога по беременности
УЗИ брахиоцефальных сосудов (МАГ)
Повторный прием ведущего акушера-гинеколога по беременности
Комплексное УЗИ вен и артерий нижних конечностей
Комплексное обследование после родов
Комплексное УЗИ вен и артерий верхних конечностей
УЗИ артерий нижних конечностей
УЗИ артерий верхних конечностей
Коррекция (уменьшение малых половых губ)
Лечение сухости и дискомфорта слизистой вульвы и влагалища препаратами гиалуроновой кислоты 1 мл
Коррекция (уменьшение больших половых губ)
УЗИ лонного сочленения
Программа ведения беременности “Премиум”
Коррекция возрастных и послеродовых изменений аногенитальной области препаратами гиалуроновой кислоты 1 мл
Лечение опущения стенок влагалища начальной стадии. Лечение опущение стенок влагалища начальной стадии препаратами гиалуроновой кислоты 2мл
Коррекция малых половых губ препаратами гиалуроновой кислоты 1 мл
Коррекция больших половых губ препаратами гиалуроновой кислоты 2 мл
Коррекция асимметрии, деформация промежности препаратами гиалуроновой кислоты 2 мл
Консультация акушера-гинеколога по планированию беременности
Увеличение объема клитора препаратами гиалуроновой кислоты 1 мл
Капельница (без стоимости препарата)
Увеличение точки G (улучшение качества сексуальной жизни)
Лечение недержания мочи у женщин (при стрессовом недержании мочи) с использованием препаратов гиалуроновой кислоты 1 мл
УЗИ почечных артерий
Плазмолифтинг интимной области
Расцеживание лактостаза+ первичный прием гинеколога
Прием врача-эндокринолога
Санация влагалища
Биопсия вульвы/влагалища
Выскабливание цервикального канала
Удаление инородного тела из влагалища
Перевязка/Снятие швов
Осмотр молочных желез на приеме гинеколога
УЗИ печени и желчного пузыря (с ЦДК)
УЗИ поджелудочной железы (с ЦДК)
УЗИ селезенки (с ЦДК)
Скрининг 1 триместра беременности “PRISCA” УЗИ + анализ крови в один день
УЗИ забрюшинного пространства (с ЦДК)
УЗИ брюшной аорты и нижней полой вены
Оформление листка нетрудоспособности по беременности и родам (без программы “Ведение беременности”)
Расширение (бужирование) канала шейки матки
Введение/удаление акушерского или гинекологического пессария (без стоимости пессария)
Дефлорация
Восстановление девственной плевы
Вскрытие абсцесса бартолиновой железы
УЗИ лимфатических узлов (одна группа) с ЦДК
УЗИ тазобедренных суставов детям (за пару)
УЗИ желчного пузыря с функцией
УЗИ полового члена (с ЦДК)
УЗИ органов мошонки (с ЦДК)
УЗИ слюнных желез (с ЦДК)
УЗИ мочевого пузыря с определением остаточной мочи (с ЦДК)
Трансректальное УЗИ предстательной железы (с ЦДК)
УЗИ висцеральных ветвей брюшной аорты
Нейросонография
Источник
Код 19.54.2.
Кал
- Приём, исследование биоматериала
- Показания к назначению
- Описание
Приём и исследование биоматериала
Приём материала
- Можно сдать в отделении Гемотест — 156 отделений
- Можно сдать анализ дома
Метод исследования
Полимеразная цепная реакция
Формат представления результата
Качественный
Когда нужно сдавать анализ Энтеровирус, РНК (Enterovirus, ПЦР) кал, кач.?
- Диагностика энтеровирусных заболеваний (полиомиелит, менингит, вирусная пузырчатка полости рта и конечностей, миокардит).
Подробное описание исследования
Род Enterovirus относится к группе РНК-содержащих вирусов семейства Picornaviridae. Включает в себя ряд возбудителей, которые вызывают различные заболевания:
- Coxsackievirus A, Echovirus – вирусная пузырчатка полости рта и конечностей (энтеровирусный везикулярный стоматит), герпетическая ангина, асептический менингит и энцефалит
- Coxsackievirus B – миокардит и перикардит.
- Poliovirus – полиомиелит.
Энтеровирусные инфекции – группа заболеваний, которые могут протекать в разных формах: бессимптомной, легкой и среднетяжелой, тяжелой. Клиническая картина энтеровирусной инфекции отличается в зависимости от возбудителя и локализации заболевания.
Менингит характеризуется появлением головной боли, повышенной температурой тела, ригидностью затылочных мышц, фотофобией и рвотой. Герпетическая ангина развивается остро, сопровождается повышением температуры, болями при глотании, головной болью, тошнотой, появлением сыпи на слизистых оболочках мягкого и твердого неба, миндалинах. Симптомы полиомиелита – лихорадка, тошнота, головная боль, нарушения глотания.
Энтеровирусный везикулярный стоматит проявляется высыпаниями на конечностях и слизистой оболочке полости рта, повышением температуры тела. Заболевание может вызываться вирусом Коксаки и другими энтеровирусами, например, энтеровирусом 71. Наиболее часто встречается у детей. При такой инфекции ребенок может отказываться от еды из-за воспаления и боли во рту и горле.
Энтеровирусная инфекция имеет сезонный характер – весенне-летне-осенний. Основные механизмы передачи – воздушно-капельный и фекально-оральный: энтеровирусы сохраняют активность в воде и способны переносить низкие температуры. Инкубационный период составляет от 2 до 35 дней, в среднем длится 7 дней. Наибольшая распространенность вируса отмечается среди детей в возрасте от 3 до 10 лет.
Попадая в желудочно-кишечный тракт, вирусы внедряются в эпителий, где происходит их первичное размножение. Вторичное размножение реализуется в сердце, коже, легких, головном и спинном мозге, куда возбудитель попадает через системный кровоток.
ПЦР-диагностика проводится для подтверждения энтеровирусной инфекции. Определение конкретного возбудителя требует дополнительных исследований.
Что ещё назначают с этим исследованием?
3.1.1.
Венозная кровь
1 день
Использованная литература
- ВОЗ. Руководящие принципы проведения эпиднадзора за энтеровирусной инфекцией. Руководящие принципы проведения эпиднадзора за энтеровирусной инфекцией в поддержку инициативы по ликвидации полиомиелита, 2015 г.
- Клинический протокол диагностики и лечения энтеровирусной инфекции, 2017 г.
- Клинические рекомендации оказания медицинской помощи детям больным полиомиелитом, 2015 г.
- Подготовка к исследованию
- Противопоказания и ограничения
Подготовка к исследованию
За 14 дней до проведения анализа на энтеровирусную инфекцию необходимо прекратить прием антибактериальных препаратов.
Перед сбором кала нельзя применять слабительные средства и клизмы.
Материал в объеме примерно 1–2 чайных ложек собирается в специальный контейнер и доставляется в лабораторное отделение в течение трех часов.
Противопоказания и ограничения
Абсолютных противопоказаний нет.
- Интерпретация результата
- Референсные значения
- Аналитические показатели
Интерпретация результата
Отрицательный результат
- Отсутствие РНК энтеровируса в исследуемом материале.
Положительный результат
- Энтеровирусная инфекция в активной форме.
- Носительство энтеровирусной инфекции.
Референсные значения
- Не обнаружено.
Аналитические показатели
Аналитическая чувствительность (фекалии) – 1х104 ГЭ/мл.
Источник
Прием биоматериала по данному исследованию может быть отменен за 2-3 дня до официальных государственных праздников, в связи с технологической особенностью производства! Информацию уточняйте в контакт-центре.
Salmonella
Shigella
Campylobacter
Adenovirus
Rotavirus A, C
Norovirus 1, 2
Astrovirus
ОКИ-тестом называют исследования 7 основных возбудителей острой диареи с помощью ПЦР, то есть с применением полимеразной цепной реакции. Такое исследование позволяет выявить причины острых кишечных инфекций (ОКИ).
Острая кишечная инфекция может быть вызвана многочисленными бактериями и вирусами, которые при активном количественном увеличении в очаге вызывают дисфункцию ЖКТ. В основном заболевание ЖКТ провоцируют шигеллы (дизентерийные палочки), сальмонеллы и кампилобактерии. Вирусами возбудителями диареи можно назвать ротавирусы, энтеровирусы, аденовирусы и норовирусы. Передается ОКИ через пищевые продукты, воду, инфицированные бытовые предметы и грязные руки. Зараженный может почувствовать первые симптомы уже спустя пару часов после инфицирования. Как правило, появляется жидкий частый стул с болями в области живота, иногда это сопровождается рвотой, тошнотой и в редких случаях лихорадкой.
Данная тест-система дает возможность определить ДНК таких возбудителей ОКИ, как сальмонеллы, шигеллы, кампилобактер, аденовирус, ротавирус, норовирус и астровирус. Биоматериалом служит кал, который сдается в стерильном контейнере, желательно до начала медикаментозной терапии. ПЦР-тест за короткий период позволит определить природу диареи и основных ее возбудителей. Исследование следует проводить в первые сутки от начала заболевания.
Стоит заметить, что острые кишечные инфекции при несвоевременном выявлении могут нарушить моторику желудочно-кишечного тракта, привести к интоксикации и иногда даже к обезвоживанию организма. В основном ОКИ-тест необходим детям, так как именно они чаще всего страдают от диареи. При этом тест необходимо проводить не только при явных признаках заражения, но и регулярно в качестве профилактики.
За 3-4 дня до проведения анализа придерживаться диеты, сбалансированной по содержанию белков, жиров, углеводов, желательно исключить из рациона орехи, грибы, копченую колбасу. Рекомендуется отмена слабительных, препаратов висмута, железа, ректальных свеч на жировой основе, ферментов и других препаратов, влияющих на процессы переваривания и всасывания. После рентгенологического исследования желудка и кишечника проведение анализа кала показано не ранее чем через 2 суток. Стул должен быть получен без применения клизм и слабительных. Перед взятием биоматериала необходимо провести тщательный туалет наружных половых органов и области заднего прохода, промыв их под душем с мылом. Допускается сбор биоматериала вечером, в этом случае полученный биоматериал хранить в холодильнике при температуре 2-8°С, не замораживая.
Источник