Сдать анализ острых кишечных инфекций
[09-134]
Острые кишечные инфекции, скрининг (Shigella spp., E. coli (EIEC), Salmonella spp., Campylobacter spp., Adenovirus F, Rotavirus A, Norovirus 2 генотип, Astrovirus)
2175 руб.
Комплексное молекулярно-генетическое исследование, которое позволяет выявить генетический материал наиболее вероятных возбудителей острых кишечных инфекций в кале и установить этиологию заболевания.
Синонимы русские
ОКИ, ПЦР (кал).
Синонимы английские
Acute intestinal infection screening; Bacterial and viral diarrhea screening, PCR, fecal samples.
Метод исследования
Полимеразная цепная реакция в режиме реального времени.
Какой биоматериал можно использовать для исследования?
Кал.
Как правильно подготовиться к исследованию?
- Исследование рекомендуется проводить до начала приема антибиотиков и других антибактериальных химиотерапевтических препаратов.
- Исключить прием слабительных препаратов, введение ректальных свечей, масел, ограничить прием медикаментов, влияющих на перистальтику кишечника (белладонна, пилокарпин и др.) и на окраску кала (железо, висмут, сернокислый барий), в течение 72 часов до сбора кала.
Общая информация об исследовании
Острые кишечные инфекции (ОКИ) – группа заболеваний, обусловленных вирусами, бактериями или паразитами, для которых характерен фекально-оральный механизм передачи. Общими для данных инфекций являются факторы передачи: пищевые продукты, вода, инфицированные бытовые предметы и грязные руки. Первые симптомы возникают через несколько часов или дней после инфицирования, начало резкое, с появлением частого жидкого стула, рвоты, боли в животе, признаков интоксикации (лихорадки, озноба, тошноты). Заболевание может носить групповой характер и проявиться у нескольких человек, употреблявших инфицированную пищу или воду.
Согласно официальной статистике, в России до 65-67% заболеваний этой группы составляют ОКИ неуточненной этиологии. Если возбудитель инфекции неизвестен, эффективность противоэпидемических мероприятий ограничивается. Соотношение частоты выявления вирусных и бактериальных патогенов варьируется в разных возрастах: у детей до 3 лет на долю вирусных агентов приходится 80-90% заболеваний, на долю бактериальных – 10-20%; среди взрослых пациентов доля вирусных возбудителей снижается до 30%.
Shigella species и Esherichia coli – грамотрицательные палочковидные микроорганизмы из семейства энтеробактерий. К роду Shigella относятся патогенные бактерии S. dysenteriae, S. flexneri, S. boydii и S. sonnei, которые являются возбудителями шигеллеза (бактериальной дизентерии). Энтероинвазивные E. coli (EIEC) очень близки с шигеллами, синтезируют и выделяют шигеллоподобный токсин, способны проникать в клетки слизистой кишечника и разрушать энтероциты, что приводит к образованию язвенных дефектов в слизистой кишечника. За значительную часть случаев “бактериологически неподтвержденной дизентерии”, особенно у детей, ответственен энтероинвазивный эшерихиоз.
Бактерии рода Salmonella относятся к семейству энтеробактерий. S. typhi и S. parathyphi являются возбудителями брюшного тифа и паратифа. Существует множество серовариантов Salmonella species, способных вызвать у человека инфекцию по типу гастроэнтероколита, а также стать причиной внутрибольничных инфекций. Сальмонеллез может протекать в форме острой кишечной инфекции, тяжелой генерализированной инфекции или бессимптомного носительства. Окончательный диагноз ставится только после выделения возбудителя или обнаружения его ДНК.
Кампилобактерии являются одними из наиболее сложных для культивирования (которое требуется в ходе анализа) микроорганизмов. Это объясняется их микроаэрофильностью и возможностью подавления их роста сопутствующей флорой. Род кампилобактерий объединяет как возбудителей ОКИ (термофильные виды), так и сапрофитные и условно-патогенные виды, о чем необходимо помнить при выявлении этих микроорганизмов в клиническом материале. Применение наборов на основе ПЦР для определения термофильной группы кампилобактерий позволяет не только избежать трудоемкой и высокозатратной бактериологической работы, но и четко ограничить детекцию тех видов кампилобактерий, которые имеют этиологическую связь с острой кишечной инфекцией (С. jejuni, C. coli, C. lari, C. upsaliensis).
В соответствии с данными зарубежной литературы, норовирус – наиболее частый возбудитель вспышек ОКИ небактериальной этиологии. Эта особенность связана с низкой инфицирующей дозой и высокой устойчивостью в окружающей среде. ПЦР является “золотым стандартом” в клинической диагностике норовирусных инфекций.
Несмотря на несколько меньшую в сравнении с рота- и норовирусами распространенность, астровирусы составляют значительный пласт кишечных инфекций, у трети пациентов протекающий с явлениями колита. Ротавирусы группы А являются наиболее частой причиной спорадических заболеваний ОКИ у детей, а ДНКсодержащий аденовирус F (серотипы 40 и 41) нередко вызывает вспышки гастроэнтеритов у детей младшего возраста.
Для выявления и дифференциальной диагностики кишечных инфекций используются культуральные и молекулярно-генетические методы исследования генетического материала возбудителя в кале и определение концентрации специфических иммуноглобулинов в крови. ПЦР обладает преимуществом перед культуральными методами благодаря быстрому получению результатов, высокой специфичности и чувствительности исследования. Данный анализ позволяет со 100-процентной точностью определить возбудителя кишечного заболевания, а быстрая диагностика острых кишечных инфекций помогает избежать лишних процедур и оперативных вмешательств, своевременно начать лечение и ограничить очаг распространения инфекции.
Для чего используется исследование?
- Для установления этиологического фактора острой кишечной инфекции;
- для дифференциальной диагностики причин острого гастроэнтероколита (воспаления ЖКТ).
Когда назначается исследование?
- При симптомах острого гастроэнтерита, вероятно, инфекционной этиологии (жидкий частый стул, рвота, лихорадка, боли в животе);
- при одновременном или последовательном развитии ОКИ у нескольких членов семьи, у детей в детском учреждении или пациентов в стационаре;
- при подозрении на развитие внутрибольничной кишечной инфекции (при обострении симптомов энтероколита у пациента, находящегося на лечении по поводу ОКИ).
Что означают результаты?
Референсные значения: отрицательно.
Причины положительного результата:
- присутствие ДНК или РНК возбудителя ОКИ; этиология в зависимости от выявленного вида возбудителя (Shigella spp., E. coli (EIEC), Salmonella spp., Campylobacter spp., Adenovirus F, Rotavirus A, Norovirus (2-й генотип), Astrovirus).
Причины отрицательного результата:
- отсутствие инфицирования Shigella spp., E. coli (EIEC), Salmonella spp., Campylobacter spp., Adenovirus F, Rotavirus A, Norovirus (2-й генотип), Astrovirus.
Важные замечания
- Рекомендуется проводить исследование в первые 3 суток с начала заболевания, у госпитализированных пациентов – в первый день госпитализации.
- Важно помнить, что острый энтероколит может быть обусловлен и другими инфекциями (например, амебами, лямблиями, иерсиниями, клостридиями, протеями и др.) или неинфекционными причинами (токсинами, ядовитыми веществами, острой непроходимостью кишечника, тромбозом сосудов брыжейки, воспалительными заболеваниями кишечника, острым панкреатитом, аппендицитом, целиакией, острым гепатитом, мальабсорбцией, дивертикулитом).
Также рекомендуется
- Yersinia pseudotuberculosis, ДНК [ПЦР]
- anti-Shigella flexneri 1-5, anti-Shigella flexneri 6, anti-Shigella sonnei
- Посев кала на патогенную флору (диз. группа и тифо-паратифозная группа)
- Посев кала на условно-патогенную флору с определением чувствительности к антибиотикам
- Анализ кала на цисты простейших
- Копрограмма
- Общий анализ крови (без лейкоцитарной формулы и СОЭ)
- Лейкоцитарная формула
- Скорость оседания эритроцитов (СОЭ)
Кто назначает исследование?
Инфекционист, гастроэнтеролог, терапевт, педиатр.
Литература
- Борисов Л. Б. Медицинская микробиология, вирусология, иммунология. М.: МИА, 2005. – 736 с.
- Gómez-Duarte O., Bai J., Newel E. Detection of E. coli, Salmonella spp., Shigella spp., Yersinia enterocolitica, Vibrio cholerae, and Campylobacter spp. enteropathogens by Three-reaction Multiplex PCR. Diagn Microbiol Infect Dis. 2009 January; 63(1): 1-9. PMCID: PMC2701628.
Источник
Подготовка к исследованию
Кал следует сдавать до начала приёма антибиотиков и химиотерапевтических препаратов (если это невозможно, то не ранее чем через 12 часов после отмены препарата). Не допустимо использование свечей. Перед исследованием необходимо исключить прием слабительных препаратов, введение ректальных свечей, масел, ограничить прием медикаментов, влияющих на перистальтику кишечника (белладонны, пилокарпина и др.) и на окраску кала (железа, висмута, сернокислого бария), в течение 72 часов до сдачи кала. Ингибирующее действие могут оказывать: гемоглобин, гепарин, билирубин и желчные кислоты, слизь, гормоны, ферменты, соли, ионы металлов продукты жизнедеятельности микрофлоры. Лекарственные препараты-антибактериальные, противовирусные, химиотерапевтические, слабительные и усиливающие моторику средства, препараты висмута, железа, сернокислого бария, ректальные свечи, в том числе и на глицериновой основе.
Описание
Вирусные диареи – это группа острых антропонозных (присущих только человеку) инфекционных заболеваний, преимущественно с фекально-оральным механизмом передачи. В меньшей степени заражение проходит воздушно-капельным путем. Для этой группы заболеваний характерны общие интоксикационные проявления, клиническая картина гастроэнтерита, а в некоторых случаях – катарально-респираторный синдром. Современные исследования показывают, что наряду с бактериальными возбудителями кишечных инфекций, все больший вклад в этиологический фактор заболеваний вносят, так называемые возбудители вирусных кишечных заболеваний (гастроинтестинальных инфекций). Их объединяют в одну группу по причине сходных клинических проявлений: повышение температуры до высоких цифр, общее недомогание, рвота (от нескольких раз до многократной и неукротимой), неоформленный, частый, жидкий стул.
В некоторых случаях манифестировать заболевание может с катаральных проявлений: умеренные боли и першение в горле, гиперемия глотки и мягкого неба, заложенность носа и слизистые выделения из носовых ходов. Зачастую заболевание носит характер групповых вспышек (в детских коллективах, в лечебных учреждениях, в детских лагерях, санаториях и домах отдыха; также нередки общие семейные заражения).
Основную опасность вирусные кишечные инфекции представляют для детей (особенно раннего возраста), пожилых людей с хроническим заболеваниями и очень опасны для лиц с иммунодефицитами. У данной группы пациентов заболевание может характеризоваться более тяжелым и длительным течением, развитием обезвоживания, электролитными нарушениями и развитием осложнений: почечная, сердечно-сосудистая недостаточность, формирование дисбактериоза кишечника и дисахаридазной недостаточности. Источником заражения является как больной человек, так и здоровые вирусоносители, выделяющие вирусы, но не имеющие клинических проявлений болезни. Механизм передачи преимущественно фекально-оральный, также передача осуществляется контактно-бытовым путем (грязные руки и предметы обихода), водным (употребление инфицированной воды), алиментарным (употребление пищевых продуктов), реже – воздушно-капельный путь передачи.
Показания к назначению
Дифференциальная диагностика этиологического фактора кишечной инфекции, предположительно вирусной этиологии ( повышение температуры, першение и боли в горле, рвота жидкий стул, боли в животе.
Дифференциальная диагностика возбудителей кишечной инфекции, предположительно вирусной этиологии в случае одновременного развития заболевания у членов семьи, у детей посещающих детское учреждение, пациентов лечебного учреждения).
Контакт с пациентом имеющим клиническую картину кишечной инфекции, предположительно вирусной этиологии для исключения заболевания.
Выявление здоровых вирусоносителей кишечных инфекций.
Интерферирующие факторы
Диуретики, энтеросорбенты
Причины отклонения показателей от нормы (повышенные значения)
Формат ответа качественный
Положительный результат- обнаружение генетического материала возбудителей вирусных кишечных инфекций, в зависимости от выделенного возбудителя осуществляется типирование по виду ( ротавирус, норовирус, энтеровирус, астравирус) c его указанием
Причины отклонения показателей от нормы (сниженные значения)
Формат ответа качественный
. Отрицательный результат- не обнаружено генетического материла возбудителей вирусных кишечных инфекций в образце биоматериала
Метод:
ПЦР с детекцией в режиме реального времени;
Анализатор:
Детектирующий амплификатор ДТ-96, ДНК-Технология, Россия;
Источник
Код 123.0.
Кал
- Приём, исследование биоматериала
- Показания к назначению
- Описание
Приём и исследование биоматериала
Приём материала
- Можно сдать в отделении Гемотест
- Можно сдать анализ дома
Когда нужно сдавать анализ Посев на возбудителей кишечной группы (Shigella spp., Salmonella spp.)?
- Комплексная диагностика заболеваний, вызванных бактериями рода Shigella и Salmonella
- Дифференциальная диагностика причин диареи
- Выявление бессимптомных и скрытых носителей бактерий рода Shigella
Подробное описание исследования
Посев кала на специальные питательные среды для диагностики основных кишечных инфекций бактериального происхождения
Одними из самых распространенных острых кишечных инфекций бактериального происхождения служат шигеллез и сальмонеллез.
Шигеллез, или бактериальная дизентерия, представляет собой инфекционное заболевание, вызываемое бактериями рода Shigella. Особенностью этих микроорганизмов является выделения множества токсинов, которые приводят не только к воспалению кишечника, но и наносят вред всему организму (способны вызывать гемолитико-уремический синдром- одна из причин развития острой почечной недостаточности).
Механизм инфицирования шигеллами – фекально-оральный. Среди них выделяют серотипы, для каждого из которых характерным является свой путь передачи: серотип dysenteriae распространяется преимущественно контактно-бытовым путем, flexneri и boydii – водным, sonnei -пищевым.
Важной причиной вспышки этой острой кишечной инфекции служит наличие невыявленных носителей, а также нарушение санитарно-гигиенических норм и технологии производства продуктов.
Сальмонеллез также относят к острым кишечным инфекциям. Источник заболевания в данном случае – бактерии рода Salmonella. Выделено множество серотипов этих микроорганизмов, для человека имеют наибольшее значение как патогены S. enterica, S. typhimurium, S. heidelberg, S. panama, S. infantis, S. anatum и некоторые другие.
Сальмонеллы также выделяют токсины, которые способствуют поражению желудочно-кишечного тракта и организма в целом. Механизм заражения данными бактериями аналогичен таковому при шигеллезе. Источниками передачи инфекции служат яйца, мясные и молочные продукты, кулинарные изделия.
Традиционно принято связывать заражение сальмонеллезом с поражением тонкой и начальных отделов толстой кишки, в то время как шигеллез – с воспалением в конечных отделах толстого кишечника. В настоящее время отмечается много стертых форм этих заболеваний, при которых клиническая картина не всегда дает представление о потенциальном возбудителе инфекции. У человека возникает диарея, боли в животе, усиление газообразование, озноб и повышение температуры тела.
Для верного выбора лечения врачу необходимо своевременно и точно выявить причину кишечной инфекции. Посев кала на питательные среды в течение многих лет является важным компонентом диагностики шигеллеза и сальмонеллеза, позволяет подтвердить диагноз и выбрать правильную тактику помощи пациенту.
Что ещё назначают с этим исследованием?
Использованная литература
1. Кишечные инфекции. Сборник учебно-методический пособий для студентов медицинских ВУЗов. 2-е изд. Под редакцией С.Г. Пака. М: 2008.
2. Инфекционные болезни. Национальное руководство. Краткое издание. Ющук Н.Д., Венгеров Ю.Я. ГЭОТАР-Медиа, 2020
3. Л.Н. Мазанкова, С.Н. Горбунов. Диагностика и лечение острых кишечных инфекций у детей. Методические рекомендации для врачей. Москва – 2012
4. Toyin Ejidokun et al. Principles and Practice Recommendations for the Public Health Management of Gastrointestinal Pathogens 2019
- Подготовка к исследованию
- Противопоказания и ограничения
Подготовка к исследованию
- Образец кала должен быть получен естественным путем: не принимайте слабительных средств и не делайте клизм.
- Для каждого из исследований кал необходимо собрать отдельный контейнер. В зависимости от количества назначенных анализов, наполните контейнеры калом в объеме 1-2 чайных ложек для каждого.
- Доставьте биоматериал в лабораторное отделение как можно быстрее после сбора, не позднее, чем через 2-3 часов.
- За три дня до исследования из рациона необходимо исключить мясо, печень, кровяную колбасу и все продукты, содержащие железо (яблоки, болгарский перец, шпинат, белую фасоль, зеленый лук, огурцы).
Факторы, влияющие на результаты исследований
1. Приём антибактериальных препаратов.
Противопоказания и ограничения
Абсолютных противопоказаний нет.
Дополнительное обследование при отклонении от нормы
3.9.1. Клинический анализ крови с лейкоцитарной формулой и СОЭ (с микроскопией мазка крови при выявлении патологических изменений) (венозная кровь)
1.39. Калий(K+), натрий(Na+), хлориды
27.113. Биохимия 8 показателей
Источник
Код 19.54.
Кал
- Приём, исследование биоматериала
- Показания к назначению
- Описание
Приём и исследование биоматериала
Приём материала
- Можно сдать в отделении Гемотест
- Можно сдать анализ дома
Метод исследования
Полимеразная цепная реакция
Формат представления результата
Качественный
Когда нужно сдавать анализ Ротавирус гр. А, норовирус 2 геногруппы, астровирус, РНК (Rotavirus A, Norovirus 2, Astrovirus, ПЦР) кал, кач.?
- Симптомы кишечной инфекции: боли в животе, вздутие, диарея.
- Острый гастроэнтероколит.
- Обследование лиц в очаге острой кишечной инфекции.
Подробное описание исследования
Исследование качественное, предназначено для выявления и дифференциации РНК ротавирусов группы А (Rotavirus A), норовирусов 2 генотипа (Norovirus 2 генотип) и астровирусов (Astrovirus) в кале методом полимеразной цепной реакции (ПЦР).
Ротавирусы группы А вызывают гастроэнтерит. Это острая инфекция, при которой поражаются органы желудочно-кишечного тракта, сопровождается диареей, из-за которой возникает риск обезвоживания. Чаще гастроэнтеритом заболевают дети до 3 лет.
Источник инфекции: больной человек.
Путь передачи: фекально-оральный.
Инкубационный период – от 1 до 5 дней. Период проявления симптомов – от 3 до 7 суток (реже более недели). Признаки инфекции:
- рвота;
- высокая температура тела;
- диарея;
- боли в горле;
- насморк.
Полное выздоровление занимает от 4 до 5 дней.
Норовирусы 2 генотипа вызывают желудочно-кишечную инфекцию.
Источник инфекции: больной человек.
Пути передачи:
- фекально-оральный;
- контактный.
Чаще всего заражение происходит через загрязненную пищу и воду.
Инкубационный период: 24–51 час, реже более длительный.
Симптомы заболевания:
- диарея;
- рвота;
- боли в животе;
- головная боль.
Болезнь длится 24–60 часов, затем симптомы исчезают.
Астровирусы — возбудители острой кишечной инфекции. Чаще поражают детей до 7 лет.
Источник инфекции: больной человек.
Пути передачи:
- фекально-оральный;
- контактный.
Инкубационный период: 3–4 дня.
Симптомы заболевания:
- диарея;
- снижение аппетита;
- тошнота.
Признаки инфекции сохраняются до 5 дней, затем проходят самостоятельно.
Метод ПЦР позволяет выявлять даже единичные копии вирусов, он эффективен в отношении возбудителей с высокой антигенной изменчивостью и внутриклеточных паразитов.
Что ещё назначают с этим исследованием?
20.6.
Венозная кровь
5 дней
Использованная литература
- Методические указания МУ 3.1.1.2969-11 “Эпидемиологический надзор, лабораторная диагностика и профилактика норовирусной инфекции”
- Клинические рекомендации (протокол лечения) оказания медицинской помощи детям больным норовирусной инфекцией.
- Клинические рекомендации вирусные диареи /острый гастроэнтерит у детей в условиях общей врачебной практики
- Методические рекомендации по применению набора реагентов для выявления и дифференциации РНК ротавирусов группы А (Rotavirus A), норовирусов 2 генотипа (Norovirus 2 генотип) и астровирусов (Astrovirus) в объектах окружающей среды и клиническом материале методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) с гибридизационно-флуоресцентной детекцией «АмплиСенс Rotavirus / Norovirus Astrovirus-FL» Вариант FEP/FRT — 2019.
- Подготовка к исследованию
- Противопоказания и ограничения
Подготовка к исследованию
За 72 часа до проведения исследования не применять ректальные свечи и масла, клизмы, слабительные препараты и лекарства, влияющие на перистальтику кишечника и окраску кала.
Противопоказания и ограничения
Абсолютных противопоказаний нет.
Результаты исследования могут быть необъективными при приеме лекарств, влияющих на перистальтику кишечника и окраску кала, а также противовирусных средств.
- Интерпретация результата
- Референсные значения
- Аналитические показатели
Интерпретация результата
Положительный результат исследования:
- наличие вирусной инфекции.
Отрицательный результат исследования:
- отсутствие вирусной инфекции;
- количество РНК возбудителей в биоматериале ниже пределов обнаружения.
Референсные значения
Не обнаружено.
Аналитические показатели
Аналитическая чувствительность:
Ротавирусы группы А (Rotavirus A) – 1х104 ГЭ/мл.
Норовирусы 2 генотипа (Norovirus 2 генотип) – 5х103 ГЭ/мл.
Астровирусы (Astrovirus) – 1х104 ГЭ/мл.
Источник